上皮性卵巢癌进展过程中的球体形成与腹膜器官定植、疾病复发和不良预后相关。尽管已证明癌症进展与转化细胞内的代谢变化有关并受其驱动,但代谢动力学与转移性形态转变之间的可能关联仍未被探索。为了解决这个问题,我们进行了定量蛋白质组学研究,以确定与高级别浆液性卵巢癌系 OVCAR-3 的三种不同形态(2D 单层和两种几何上独立的三维球体状态)相关的蛋白质特征。将蛋白质状态整合到基因组规模的代谢模型中,使我们能够为 OVCAR-3 细胞系的每个形态阶段构建特定于上下文的代谢模型,并系统地评估它们的代谢功能。我们利用这些模型获得了驱动疾病的代谢反应模块,并阐明了基因敲除策略以减少与疾病进展相关的代谢改变。我们探索了 DrugBank 数据库以挖掘药剂,并评估了药物在抑制癌症进展方面的作用。最后,我们通过实验验证了我们的预测,证实了我们预测的药物之一:神经氨酸酶抑制剂奥司他韦能够破坏转移性球状形态,而不会对未转化的基质间皮单层细胞产生任何细胞毒性作用。