摘要 为探讨COVID-19与白塞氏病(BD)关系的潜在作用,寻找相关的生物标志物。采用生物信息学方法下载COVID-19患者外周血单核细胞(PBMCs)和BD患者PBMCs的转录组数据,筛选COVID-19与BD之间的共同差异基因,进行基因本体(GO)和通路分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选枢纽基因并进行共表达分析。此外,还构建了基因-转录因子(TFs)-miRNA网络、基因-疾病网络和基因-药物网络,以深入了解两种疾病之间的相互作用。我们使用了GEO数据库(GSE152418、GSE198533)中的RNA测序数据集。通过交叉分析获得461个上调的共同差异基因和509个下调的共同差异基因,绘制PPI网络,并利用Cytohubba筛选出关联最强的15个基因作为枢纽基因(ACTB、BRCA1、RHOA、CCNB1、ASPM、CCNA2、TOP2A、PCNA、AURKA、KIF20A、MAD2L1、MCM4、BUB1、RFC4、CENPE)。筛选出具有统计学意义的枢纽基因,发现ACTB在BD和COVID-19中均处于低表达状态,ASPM、CCNA2、CCNB1、CENPE在BD中处于低表达状态,而在COVID-19中处于高表达状态。随后进行GO分析和通路分析,获得共同的通路和生物反应过程,提示BD与COVID-19之间存在共同的关联。基因-TFs-miRNA网络、基因-疾病网络和基因-药物网络也在两种疾病的相互作用中发挥重要作用。COVID-19和BD之间存在相互作用。ACTB、ASPM、CCNA2、CCNB1和CENPE是两种疾病的潜在生物标志物。
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