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BAM文件(*.bam)是用于表示对齐序列的SAM文件的压缩二进制版本。BAM文件存储的对齐序列数据,其中包括有关每个读取映射到参考基因组的信息。BAM文件包含标头部分和一个对齐部分:标题 - 包含有关整个文件的信息,例如示例名称,示例长度和对齐方式。对齐与标题部分中的特定信息相关联。对齐 - 包含读取名称,读取顺序,读取质量,对齐信息和自定义标签。读取名称包括染色体,启动坐标,对齐质量和匹配描述符字符串。

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