抽象的单细胞数据越来越多地用于基因调节网络(GRN)推断,并且基于模拟数据开发了基准。ho w e v er,e xisting单细胞模拟器无法对基因扰动的影响进行建模。进一步的挑战在于产生经常在计算和稳定问题上挣扎的大规模GRN。我们介绍Genespider2,Genespider Mat-Lab工具X F或GRN基准测试,推理和分析SIS的更新。se v eral softw是模块的功能和出色的功能,并添加了NE W功能。一个主要的精力是在无规模的分布和模块化方面生成具有生物学上现实拓扑特性的大型GRN的能力。另一个主要补充是对单细胞数据的模拟,该数据越来越流行,作为GRN推断的输入。具体来说,我们引入了独特的功能,以基于遗传扰动生成单细胞数据。最后,将模拟的单细胞数据与来自两个细胞系的真实单细胞扰动数据进行了比较,表明合成和真实数据表现出相似的属性。
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