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与其他冠状病毒一样，SARS-COV-2基因表达策略是基于嵌套亚基因组mRNA物种（SGRNA）的合成。这些SGRNA是使用“不连续的转录”机制合成的，该机制依赖于在转录调节序列（TRS）下切换的模板切换。可以产生典型（c- sgrna）和非典型的（NC-SGRNA，较少）亚基因组RNA物种。当前，根据下一代测序（NGS）获得的序列数据研究了SGRNA，生物信息学工具对于它们的识别，表征和定量至关重要。迄今为止，该目标很少有软件，他们的可靠性和适用性需要建立在所有可用的NGS平台上，以建立对这些工具产生的信息的信心。实际上，这些信息可能对阐明病毒表达策略的深入阐明至关重要，尤其是在NC-SGRNA的意义上，以及可能将SGRNA用作感染患者病毒复制活性的潜在标记。
sgrnas
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