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Stanislav A. Bondarev 1*,Maya V. Uspenskaya 2,JérémyLeclercq3,ThéoFalgarone3,Galina A. Zhouravleva 1和Andrey V. Kajava 3* 1 1 2 197101年,圣彼得堡生物工程ITMO大学研究所,俄罗斯联合会,3中心,Recherche En Biologie Cellulaie de Montpellier,CNRS,CNRS,MontpellierUniversité,Montpellier,34293,法国 *在这些原纤维中,每个多肽链都采用相同的含二含量的构象,并且这些链以平行和内寄存器的方式堆叠。在过去的几年中,关于不同淀粉样蛋白蛋白的共聚集的大量数据已经积累了大量数据。在已知的聚集示例中是不同酵母菌蛋白和人类蛋白RIP1和RIP3的杂聚集物。由于共聚集与功能性淀粉样蛋白的淀粉样蛋白的感染性和分子机制等重要现象有关,因此我们在更多细节中分析了其结构方面。在同一淀粉样纤维中,不同蛋白质的轴向堆叠是最常见的聚集类型之一。通过使用基于淀粉样蛋白增长尖端的结构相似性的方法,我们开发了一种计算方法来预测能够通过轴向堆积相互相互作用的淀粉样蛋白生成 -ark结构。此外,我们编制了一个数据集,该数据集由26对具有或无能力共聚集的蛋白质对组成。我们利用此数据集测试和完善我们的算法。开发的方法为多种应用开辟了一种方法,包括鉴定能够触发人类淀粉样变性的微生物蛋白。amylocomp可在网站上找到:https://bioinfo.crbm.cnrs.fr/index.php?route = tools&tool = 30。

用于预测淀粉样蛋白共聚集的生物信息学工具

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