s7表:目标读取深度对相对于3000倍深度值所显示的成本和时间的影响。在500x,1000x,2000x,3000x,4000x和5000x的特定读取深度上进行参数与序列144个样本的比较,相对于3000x深度的值显示(BOLD表示)。生物信息学分析的时间涵盖了从RAW NGS数据到变体列表的输出的管道,不包括此列表的策划。可以通过在每次运行中包括较大数量的样本来实现较低的读取深度(500倍)。这需要每144个样本的成本和时间进行准备和定量,并且由于每次运行的样本数量增加和较小的原始数据文件,总成本降低了0.8倍,总时间减少了0.7。增加深度,以实现非常低的VAF的准确测序,总体上总成本和时间要求提高了1.1至1.3倍。以小时和澳元的原始值参考S8表。
主要关键词