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摘要：Type-v-f cas12f蛋白，也称为Cas14，由于其紧凑的大小，在不同的CRISPR-CAS核中引起了显着的兴趣。这项研究涉及通过采矿，序列比较，系统发育分析和阵列/重复分析来分析和比较原核生物基因组中的Cas14-词素蛋白。在我们的分析中，我们识别并挖掘了总共93种CAS14-学蛋白，大小从344 AA到843 AA不等。在该分析中发现的大多数CAS14-词素蛋白都在Firmicutes组中发现，其中包含37种，占所有CAS14-词素蛋白的42％。在古细菌中，DPANN组的物种数量最多，其中包含CAS14-同源蛋白，总共三种。系统发育分析结果表明，Cas14-词素蛋白分为三个进化枝：Cas14-A，Cas14-B和Cas14-U。通过三个进化枝的域比较在C末端（CTD）上观察到广泛的相似性，这表明由于该区域中切割域的存在，可能存在潜在共享的作用机理。此外，对所有识别的CAS14序列的序列相似性分析表明，蛋白质变体之间的相似性水平较低（18％）。对认同的Cas14-学蛋白的扩展核苷酸序列中重复/阵列的分析强调，在总开采蛋白中具有CRISPR相关的重复序列中有44个，其中20个是CAS14。我们的研究有助于增加对原核生物基因组Cas14蛋白的了解。这些同源蛋白具有将来在CAS14蛋白的采矿和工程中应用的潜力。
CAS14- ...
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