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产品描述Zymobiomics®微生物群落DNA标准II（对数分布）是八个细菌和两种真菌菌株的基因组DNA的混合物。微生物标准是准确表征的，并且包含可忽略的杂质（<0.01％）。它是通过从十种微生物菌株的纯培养物中提取的汇总DNA构建的。在合并之前对每个纯培养物的DNA进行了量化。混合后，使用基于NGS的测序确认微生物组成（图1）。该微生物标准可用于评估微生物工作流程的性能，也可以用作常规QC目的的阳性对照。DNA样品混合以创建对数分布的丰度（表1），这使用户可以轻松评估微生物学工作流的检测极限。1 µL标准（11 ng DNA）可用于评估标准中包含的金黄色葡萄球菌的丰度，该检测极限为0.000089％，相对丰度为0.000089％，或相当于3个细胞的DNA量。如果需要，标准也可以与人类基因组DNA相混合，例如人类HCT116 DKO DNA（＃D5014-1），以模仿人类微生物组样本。可以在表2中找到有关十种微生物菌株（包括物种名称，基因组大小，平均GC含量，16S/18S拷贝数，系统发育）的详细信息。从下面的链接中获得了这些菌株的16S＆18S rRNA序列（FASTA格式）和基因组（FASTA格式）。如果您需要帮助分析从此标准2生成的测序数据，请随时与我们联系。参考基因组下载：https：//zymo-files.s3.amazonaws.com/biopool/zymobiomics.std.refseq.v3.zip关于微生物组标准需求的背景：微生物组成概要配置文件在下一代测序中启动了由Microbobiomics和Metegenomics研究的常规测序，并成为了MetageNomics的常规研究。众所周知，这些分析技术在工作流程的每个步骤中都会遭受偏差和错误，包括DNA提取，图书馆制备，测序和生物信息学分析。要评估不同微生物学工作流的性能，该领域迫切需要可靠的参考材料，例如具有定义成分的模拟微生物社区。1个基因组DNA；该DNA标准不是独立于Zymobiomics®微生物社区标准II（＃D6310）的直接衍生物和制造。2我们可以使用内部管道来帮助评估该标准的测序数据中的偏差程度。
Zymobiomics®微生物社区DNA标准II（...
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