与癌症相关的静脉血栓栓塞(VTE)是肿瘤成本,发病率和死亡率的主要来源。识别高危患者进行预防性抗凝治疗具有挑战性,并增加了临床医生负担。循环肿瘤DNA(CTDNA)测序测定法(“液体活检”)已被广泛实施,但是它们的VTE预后效用尚不清楚。在这里,我们分析了三个血浆测序队列:一个泛癌发现队列,由4,141例非小细胞肺癌(NSCLC)或乳腺癌,胰腺和其他癌症患者组成;一个前瞻性验证队列,由1,426例具有相同癌症类型的患者组成;以及463例晚期NSCLC患者的国际概括性队列。ctDNA检测与VTE相关,与临床和放射学特征无关。在液体活检数据上训练的机器学习模型的表现优于先前的风险评分(发现,验证和概括性c-Indices 0.74、0.73和0.67,而Khorana分数为0.57、0.61和0.54)。在现实世界数据中,如果检测到ctDNA,则抗凝VTE速率较低(n = 2,522,调整危险比(HR)= 0.50,95%置信区间(CI):0.30-0.81); ctDNA-患者(n = 1,619)没有受益于抗凝作用(调整后的HR = 0.89,95%CI:0.40–2.0)。这些结果提供了初步证据,表明除临床参数外,液体活检还可以改善VTE风险分层。需要进行介入的随机前瞻性研究,以确认液体活检的临床效用,以指导癌症患者的抗凝治疗。