图1 Polyq疾病蛋白的αFOLD结构。 (A) Predicted AlphaFold protein model of full-length ATXN1 (Human; AF-P54253), (B) ATXN2 (Human; AF-Q99700), (C) ATXN3 (Human; AF-P54252), (D) ATXN7 (Human; AF-O15265), (E) CACNA1A (Human; AF-O00555), (F) TBP(人类; AF-P20226),(G)AR(人类; AF-P10275)和(H)ATN1(Human; AF-P54259)。 (i)预测氨基酸残基1至413的Alphafold蛋白模型HTT(HTTQ21(1-414)),其中包含21个聚谷氨酰胺。 预测的HTTQ21(1-414)AlphaFold模型叠加在灰色(蛋白质数据库ID 6x9O,2.60Å分辨率[99]中显示的Cryo-EM确定的HTT-HAP40蛋白结构[99],其中未在Cryo-Em结构中确定PolyQ区域。图1 Polyq疾病蛋白的αFOLD结构。(A) Predicted AlphaFold protein model of full-length ATXN1 (Human; AF-P54253), (B) ATXN2 (Human; AF-Q99700), (C) ATXN3 (Human; AF-P54252), (D) ATXN7 (Human; AF-O15265), (E) CACNA1A (Human; AF-O00555), (F) TBP(人类; AF-P20226),(G)AR(人类; AF-P10275)和(H)ATN1(Human; AF-P54259)。(i)预测氨基酸残基1至413的Alphafold蛋白模型HTT(HTTQ21(1-414)),其中包含21个聚谷氨酰胺。预测的HTTQ21(1-414)AlphaFold模型叠加在灰色(蛋白质数据库ID 6x9O,2.60Å分辨率[99]中显示的Cryo-EM确定的HTT-HAP40蛋白结构[99],其中未在Cryo-Em结构中确定PolyQ区域。HTTQ21(1-414)模型高度对齐冷冻结构。由黑色矩形构建的残基代表野生型Polyq区域。比例尺表示源自AlphaFold预测的PLDDT值,并表示每日置信度度量[97]:PLDDT> 90,高精度; 90> plddt> 70建模良好; 70> PLDDT> 50低置信度; PLDDT <50差精度。ar,雄激素受体; ATN1,Atrophin 1; atxn1,ataxin 1; atxn2,ataxin 2; atxn3,ataxin 3; atxn7,ataxin 7; Cacna1a,钙电源门控通道亚基Alpha1 A(Cav2.1);冷冻电子,冷冻电子显微镜; HTT,亨廷顿; PLDDT,每个保留模型置信度评分; Polyq,聚谷氨酰胺; TBP,TATA结合蛋白。
主要关键词