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生物医学文本提供了重要数据,用于研究药物守护领域中的药物相互作用(DDIS)。尽管研究人员试图研究生物医学文本中的DDI并预测未知的DDI,但缺乏准确的手动注释会大大阻碍机器学习算法的性能。在这项研究中,为DDI(Subge-DDI)开发了一个新的DDI预测框架,即子图增强模型,以提高机器学习算法的性能。此模型使用药物对知识子图信息来实现大规模的纯文本预测,而无需进行任何注释。该模型将DDI预测视为多类分类问题,并预测每种药物对的特定DDI类型(例如,机制,效果,建议,相互作用和负面)。药物对知识子图源自包含各种公共数据集的巨大药物知识图,例如药物库,二固体,偏外,药物中心,胚胎,SMPDB(小分子途径数据库),CTD(比较毒性毒理学数据库)和Sider。从公共数据集(Semeval-2013 Task 9数据集)评估了Subge-DDI,然后与其他最先进的基线进行了比较。Subge-DDI在测试数据集中获得83.91%的微F1分数和84.75%的宏F1分数,表现优于其他最先进的基线。这些发现表明,提出的药物对知识子图辅助模型可以有效地改善生物医学文本中DDI的预测性能。

subge-ddi:药物的新预测模型

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