最普遍的神经退行性疾病是阿尔茨海默氏病(AD)和帕金森氏病(PD)。AD和PD均被归类为蛋白质病,在PD中发现了AD中错误折叠的淀粉样蛋白β和α-突触核蛋白中的tau蛋白。主要的广告标志是记忆丧失,在PD中发现多巴胺能神经元的丧失和Lewy-Bodies的发展。运动神经元活性中的缺陷在多巴胺能神经元失去50-70%后,可以注意到NABESIA NIGRA(SN)地区。新兴证据表明,错误折叠的蛋白质缠结和/或斑块具有prion样蛋白,这是引起发病机理的主要因素。可能影响这些疾病病理的其他因素包括氧化应激,线粒体损伤,炎症和与年龄相关的细胞死亡。慢性炎症也被普遍认为在PD的启动和发展中起着核心作用。