项目背景:微生物组在人类健康和疾病中起重要作用。下一代16S rRNA基因测序是一种强大的技术,用于表征粪便,诸如感染,癌症,糖尿病,神经退行性疾病和肥胖等疾病的样品中的细菌组成。微生物组分析有望有望诊断和整合常规临床微生物学。但是,16S测序数据所需的生物信息学分析的复杂性仍然是一个主要障碍。开发简化的管道来简化此分析对于常规诊断使用至关重要。目标:该项目的目的是通过一般微生物组组成输出来构建和验证16S rRNA基因测序分析的标准化生物信息学管道和工作流程。方法:Qiime2将与NextFlow结合使用,以创建标准化的16S rRNA测序工作流,用于微生物组分析。微生物组测序和常规诊断的分析数据将用于测试和验证工作流程。