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抽象的单细胞RNA测序（SCRNA-SEQ）提供了单个细胞的表达谱，但无法保留关键的空间信息。另一方面，空间杂交技术能够分析组织切片中的特定区域，但缺乏单细胞分辨率检查的能力。为了克服这些问题，我们提出了单细胞和空间转录组学对齐（SSA），这是一种新型技术，它采用最佳传输算法来根据其表达曲线将单个细胞从SCRNA-SEQ ATLAS分配到其在实际组织中的SPATIAL位置。SSA与现有方法相比，已经证明了具有100,064个细胞的高分辨率空间转录组人乳腺癌数据集的10个半模拟数据集。这一进步为研究人员提供了一种精致的工具，以深入了解细胞空间组织与基因表达之间的关系。
SSA：一种新型的单细胞和空间转录组对齐方式
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