耳蜗的功能分子表征主要由神经性耳聋遗传结构的解析所驱动。因此,寻找听力领域极为缺乏的治愈性治疗方法已成为一个可能实现的目标,特别是通过耳蜗基因和细胞疗法。为此,一份完整的耳蜗细胞类型清单以及对其基因表达谱直至最终分化的深入表征是必不可少的。因此,我们基于对出生后第 8 天 (P8) 的 120,000 多个细胞的分析,生成了小鼠耳蜗的单细胞转录组图谱,这些细胞处于听力前期,P12 对应于听力开始,P20 对应于耳蜗成熟几乎完成。通过将全细胞和核转录分析与广泛的原位 RNA 杂交试验相结合,我们表征了涵盖几乎所有耳蜗细胞类型的转录组特征并开发了细胞类型特异性标记。发现了三种细胞类型;其中两种构成了容纳主要听觉神经元和血管的耳蜗轴,第三种细胞由内衬前庭阶的细胞组成。结果还揭示了基底膜生物物理特性的声音梯度的分子基础,而这种梯度是耳蜗被动声频分析的关键基础。最后,我们还揭示了几种耳蜗细胞类型中被忽视的耳聋基因表达。该图谱为破译控制耳蜗细胞分化和成熟的基因调控网络铺平了道路,这对于开发有效的靶向治疗方法至关重要。