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分子模块在药物设计中的作用
苏珊特大学卫生科学学院副教授Sunil Kumar博士,Gurugaram分子建模,是指使用计算方法来代表,可视化和模拟分子及其相互作用。它允许科学家根据原子坐标构建分子结构模型,并在不同条件下预测分子的行为。 …继续阅读“分子模块在药物设计中的作用”
来源:苏尚特大学博客Gurugaram Sushant University卫生科学学院药学系副教授Sunil Kumar博士
分子建模是指使用计算方法来表示,可视化和模拟分子及其相互作用。它允许科学家根据原子坐标构建分子结构模型,并在不同条件下预测分子的行为。通过使用高级算法和计算机模拟,分子建模提供了对化学过程和分子动力学的更深入的了解。分子建模中有几种技术:
量子力学:量子力学用于描述分子的电子结构。与分子力学(近似原子的行为)不同,量子力学考虑了电子的波函数和量子理论的原理。
量子力学分子力学:分子力学涉及使用经典物理来模拟分子中原子之间的相互作用。它将原子视为弹簧的球体和键,从而使系统以计算系统势能的力场进行建模。
分子动力学(MD):分子动力学模拟对原子的运动随时间模拟,从而使科学家可以研究分子如何实时相互作用和变化构象。通过应用牛顿物理学,MD模拟计算作用于原子的力并预测其运动。
对接研究:分子对接用于预测两个分子之间的相互作用,通常为蛋白质和配体(例如药物分子)。停靠的目的是找到两个分子之间的最佳结合构型,这可以为药物设计和治疗剂的发展提供宝贵的见解。
对接研究分子建模的应用:•蛋白质结构和功能•药物发现和设计•材料科学•环境化学•农业科学