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利用逆对接指纹重新利用 SARS-CoV-2 药物
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 或 SARS-CoV-2 是一种属于冠状病毒科的病毒。这类病毒通常会引起感冒，但具有巨大的致病潜力。在人类中，由 SARS-CoV 病毒引起的 SARS 疫情于 2003 年首次报道，随后 2012 年，中东呼吸综合征冠状病毒 (MERS-CoV) 导致中东呼吸综合征 (MERS) 疫情爆发。此外，COVID-19 是一个严重的社会经济和全球健康问题，已夺走了 400 多万人的生命。迄今为止，只有少数几种治疗方法可以对抗这种疾病，而且只有一种直接作用的抗病毒药物，即有条件批准的瑞德西韦。由于迫切需要针对 SARS-CoV-2 的有效药物，药物再利用策略是实现这一目标的最快方法之一。进行了一项使用两种方法的计算机模拟药物再利用研究。对 FDA 批准的 SARS-CoV-2 主蛋白酶药物数据库进行了基于结构的虚拟筛选，并确定了 11 种具有已知 3CL pro 活性的得分最高的化合物，同时使用该方法报告了另外 11 种潜在的全新 3CL pro 抑制剂。然后，对整个病毒蛋白数据库以及冠状病毒科蛋白子集进行逆分子对接，以详细检查命中化合物。不是进行靶向筛选，而是为每种命中化合物以及作为对照的五种最常报告和直接作用的再利用药物生成逆对接指纹。通过这种方式，检查和比较了靶向命中空间，我们可以支持对所有 11 种新报告的 SARS-CoV-2 3CL pro 命中化合物进行进一步的生物学评估，并建议对抗蠕虫类成员化合物进行进一步的深入研究。作者承认该方法对于未来成熟的逆对接指纹筛选具有普遍的实用性。
虚拟现实作为手动航天器对接的培训援助
可以在太空任务期间手动将航天器对接到空间站的能力对于宇航员至关重要。基于计算机的自学习程序6DF是一个抽象的对接模拟，用于习得和维护基础技能，以控制六个自由度。这项复杂任务的困难之一是仅基于二维信息来构建空间中自己位置和方向的心理表示。为了促进这一点，并可能进一步改善了学习过程，测试了该程序的新的三维（3D）立体声范围内显示。这项研究调查了与标准2D呈现相比，3D演示的学习进度是否更快。24个与ESA（AGBRESA）的人工重力床REST研究的参与者参加了6DF对接实验。他们每个人完成了20次培训课程，持续了大约45分钟，每周进行两次。学习计划是自给自足的，并适应了个人学习速度。一半的参与者被呈现基于统一的立体声镜头可视化对接的范围可视化，而另一半则使用了学习程序6DF的标准2D版本。学习进度是作为达到目标任务所需的任务数量的。结果总体表明，使用3D技术时的学习进度略高，但没有长期的性能优势。较小的好处可能无法证明使用价格更高且在操作上限制3D系统的使用是合理的。
目标 太空对接 里程碑 wi spadex 任务
什么是太空对接？ 太空对接是两个航天器或模块在太空中相互连接或附着的过程。这项技术允许航天器在轨道上对接，以实现特定目标。对接过程通常涉及一艘航天器（追逐者）接近另一艘航天器或空间站（目标）并与其对齐，以进行物理连接。 1. 空间站组装：对接是建造大型太空结构（如空间站）的关键，空间站中多个模块分别发射，然后在轨道上对接在一起。 2. 卫星维修：对接使航天器能够与卫星连接，以便在轨道上加油、维修或升级，从而延长卫星的使用寿命，而无需发射替换件。 3. 机组人员转移：对于载人航天任务，对接允许宇航员在航天器之间或航天器与空间站之间转移。 4. 资源共享：对接的航天器可以传输补给、电力和数据，支持深空探索等长期任务。太空对接是如何进行的
生物利用度研究和分子对接酚类化合物
罗勒（Ocimum Sanctum L.）是一种在印度尼西亚等热带地区生长的植物。该植物通常用作蔬菜或蔬菜。此外，O。Sanctum L.还拥有克服咳嗽，发烧，头痛等的财产（Chowdhury和Koike，2010年； Rahman等，2013）。均以提取物和化合物的形式均具有药理学活性，例如抗癌，抗氧化剂，抗炎性，抗炎性，抗糖尿病，抗菌药物，抗菌素，抗菌素，利什曼尼疗法，清虫和辐射保护剂。O. sanctum L.中包含的一些继发代谢产物是一种简单的酚类，多酚（黄酮类似，库玛林，新木剂），精油，三萜，倍半萜类化，类固醇，类固醇，糖苷，糖苷和甲状腺素（Singh and Cherebroade）（Singh和Chaudhuri，2018年）。
对设计的苯咪唑衍生物的分子对接分析为EGFR
摘要非小细胞肺（NSCL）和结直肠癌经常与表皮生长因子受体（EGFR）的致癌激活相关，这是受体酪氨酸激酶（RTK）家族的成员。当前的酪氨酸激酶抑制剂（TKI）容易受到耐药性突变的影响，并诱导了对正常EGFR S的细胞毒性作用。带嘌呤的苯咪唑的同余性质具有模仿基于嘌呤的ATP的结合模式并防止其与EGFR活性位点的接触的巨大潜力。在这里，我们报告了50种设计的苯咪唑衍生物以及Gefitinib和ATP的分子对接，以分析和比较EGFR WT和T790M活性位点的结合模式。配体的设计基于我们先前的研究，我们建议评估与双键接头的酮和氨基 - 苯并咪唑，以及在各个位置附有电子捐赠和电子撤回的苯基基团。对接模拟表明，酮苯并咪唑在两个EGFR配合物中占据了前十名最高结合亲和力。与其他具有-8.1（7C）和-7.8（11C）KCAL/MOL在EGFR WT中的结合能相比，具有更稳定的复合物的磺酰基取代基的存在，eGFR WT中的结合能，-8.3（7d）和-8.4（7d）和-8.4（1c）kcal/mol for t790m t790m for T790m。对苯咪唑的取代影响不仅有助于氢键和疏水相互作用，而且还对经常被转化的范德华力的力，这些力是负责苯并咪唑与EGFR结合口袋的形状互补性的负责。
印度尼西亚活性海洋化合物的分子对接研究
1 农业研究计划，艾哈迈德达兰大学农业学院，印度尼西亚 *通讯作者：ikhymanno97@gmail.com 摘要 背景：许多天然和合成疗法被用于帮助 COVID-19（2019 冠状病毒病）患者的康复，但抑制这种病毒的有效性仍需进一步研究。 目的：预测海参中的硫酸软骨素化合物是否对 COVID-19 具有抗病毒活性。 方法：使用分子对接方法，基于硫酸软骨素与 6LU7 和 2GTB 蛋白（COVID-19 中发现的主要蛋白酶 (M pro)）的相互作用，测试其对 COVID-19 的抗病毒活性。研究阶段包括准备6LU7和2GTB蛋白质结构数据库，使用Biovia Discovery Studio应用程序准备和优化3D硫酸软骨素结构，以及使用Autodock 4.2应用程序验证6LU7和2GTB蛋白质上的分子对接和硫酸软骨素对接方法。结果：硫酸软骨素与6LU7蛋白具有较高的亲和力并形成氢键，其对6LU7受体的亲和力值为（-9.5 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000），而2GTB蛋白的亲和力较低，即对2GTB受体的亲和力值为（-7.7 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000）。结论：根据分子对接研究结果，硫酸软骨素具有抗病毒潜力，因为它与 6LU7 和 2GTB 蛋白具有亲和力，可以抑制 COVID-19 病毒的感染途径。关键词：COVID-19，硫酸软骨素，6LU7 和 2GTB 受体，分子对接
在计算机分子对接研究和Adme -Tox预测中...
本研究研究了基于自由结合能（δg）的潜在活性预测以及对ARTOCARPUS冠军（Lour。）的植物复合的相互作用确认。使用二肽基肽酶IV（DPP -IV）的大分子蛋白受体在硅分子对接研究中，以及物理化学和药代动力学特性（ADME -TOX）预测方法。使用Autodock v4.2.6（100个对接运行）将DPP -IV受体大分子蛋白蛋白数据库（ID：1×70）的活性子站点停靠。一个52×28×26Å点的网格盒子由0.37Å的距离为X =40.926Å的活动位置； y =50.522Å; Z =35.031Å。用于ADME -TOX预测，使用了基于瑞士的在线申请计划。结果表明，基于δg值和相互作用构象，来自A.冠军的12个Pythocompound具有DPP -IV抑制剂的潜力。比天然配体有五个具有较低δg值和抑制常数的Pythocompounds，七个具有δg值和抑制常数接近天然配体的Pythocompounds。12种化合物在DPP -IV受体的活性子矿石上形成了一种相互作用构象。同时，Adme -Tox预测分析的结果表明，这12种化合物具有不同的物理化学和药代动力学特性。
在硅分子对接活跃的邦格叶化合物...
摘要前列腺癌是最常见的恶性疾病，是死亡的主要原因。已知Bungur叶（Arjunate酸，ASI酸，油酸，ursolic酸和染色酸）的活性化合物已知具有抑制雄激素受体的能力。这项研究的目的是确定雄激素受体抑制抗癌的活性，知道能量结合及其在雄激素受体上的相互作用的价值，了解对接化合物的药代动力学特征。本研究使用Bungur叶子的对接分子方法（Lagerstoremia speciosa（L。））作为测试化合物，1GS4作为前列腺癌中雄激素受体的靶蛋白。在计算机分子对接中使用AutoDockTools软件，DiscoveryStudioSlient，PubChem，Marvinsketch和ADMET预测使用AdmetLab 2.0 WebServer。基于以静态三萜的形式获得的结果，其中包括23个羟基酸盐酸，Asi-Acid，灰甲酸，灰核酸，阿朱酸酯酸，耐氧酸和荷尔酸是在Lagersstromia氏族中发现的几种化学化合物。染色酸，结肠酸，荷甲酸和β-位乙醇糖苷是一些三萜类化合物，这些三萜在通过扁平酸中发现的三萜类化合物，显示出抑制作用和其他活性化合物之间的最佳能量结合值。并且具有良好的药代动力学价值。关键字：灌木叶，雄激素受体，前列腺癌的活性化合物，在硅分子对接中。
反向对接在小分子药物研究中的应用及
随着结构生物学和数据挖掘的发展，计算机辅助药物设计（CADD）在新药研发的各个环节中发挥着重要作用。反向对接是一种基于CADD中分子对接的虚拟筛选方法，因其能够寻找能够与给定配体分子结合的大分子靶标，在药物重新定位、药物拯救和中药研究中有着广泛的应用。本文介绍了反向对接的原理，总结了常见的靶标蛋白数据库和对接步骤，并列举了反向对接在药物重新定位、药物不良反应、中药和COVID-19治疗中的应用。希望我们的工作能给从事药物开发的研究人员一些启发。