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1 农业研究计划，艾哈迈德达兰大学农业学院，印度尼西亚 *通讯作者：ikhymanno97@gmail.com 摘要 背景：许多天然和合成疗法被用于帮助 COVID-19（2019 冠状病毒病）患者的康复，但抑制这种病毒的有效性仍需进一步研究。 目的：预测海参中的硫酸软骨素化合物是否对 COVID-19 具有抗病毒活性。 方法：使用分子对接方法，基于硫酸软骨素与 6LU7 和 2GTB 蛋白（COVID-19 中发现的主要蛋白酶 (M pro)）的相互作用，测试其对 COVID-19 的抗病毒活性。研究阶段包括准备6LU7和2GTB蛋白质结构数据库，使用Biovia Discovery Studio应用程序准备和优化3D硫酸软骨素结构，以及使用Autodock 4.2应用程序验证6LU7和2GTB蛋白质上的分子对接和硫酸软骨素对接方法。结果：硫酸软骨素与6LU7蛋白具有较高的亲和力并形成氢键，其对6LU7受体的亲和力值为（-9.5 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000），而2GTB蛋白的亲和力较低，即对2GTB受体的亲和力值为（-7.7 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000）。结论：根据分子对接研究结果，硫酸软骨素具有抗病毒潜力，因为它与 6LU7 和 2GTB 蛋白具有亲和力，可以抑制 COVID-19 病毒的感染途径。关键词：COVID-19，硫酸软骨素，6LU7 和 2GTB 受体，分子对接
印度尼西亚活性海洋化合物的分子对接研究
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