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语言的神经结构：综合建模集中于预测处理
最近，感知的神经科学被一种综合建模方法彻底改变了，其中计算、大脑功能和行为通过许多数据集和许多计算模型联系在一起。通过揭示跨模型的趋势，这种方法为目标领域的认知和神经机制提供了新的见解。我们在这里介绍了一项系统性研究，将这种方法应用于更高层次的认知：人类语言处理，这是我们物种的标志性认知技能。我们发现，最强大的“Transformer”模型可以预测神经对句子反应的几乎 100% 的可解释方差，并且可以推广到不同的数据集和成像方式（功能性 MRI 和皮层脑电图）。模型的神经拟合（“大脑分数”）和行为反应拟合都与下一个词预测任务（但不是其他语言任务）的模型准确率密切相关。模型架构似乎对神经拟合有很大贡献。这些结果提供了计算明确的证据，表明预测处理从根本上塑造了人类大脑的语言理解机制。
Cubic-Cloud：针对社区驱动的全鼠脑映射的综合计算框架
组织清除技术的最新进步为研究人员提供了无与伦比的机会，可以在细胞分辨率下探索整个小鼠大脑。随着这种实验技术的扩展，需要有效分析和集成全脑映射数据集的可扩展且易于使用的计算工具。到此为止，我们在这里提出了Cupic-Cloud，这是一个基于云的框架，旨在量化，可视化和集成整个鼠标脑数据。Cubic-Cloud是一个完全自动化的系统，用户可以在其中上传其全脑数据，运行分析并发布结果。我们通过多种应用来证明立方云的通用性。首先，我们研究了PV，SST，CHAT，TH和IBA1表达细胞的大脑范围分布。第二，对AD模型小鼠大脑中的β斑块沉积进行了定量。第三，我们通过C-FOS免疫染色在LPS诱导的炎症下重建神经元活性。最后，我们通过伪型狂犬病病毒显示了整个大脑的连通性映射。共同提供了一个集成平台，以推动可扩展和协作的全脑映射。
整合蛋白质组学揭示红细胞生成中动态磷酸化信号网络的原理
Karayel 等人报告了他们基于质谱 (MS) 的蛋白质组学分析结果，该分析针对处于不同成熟阶段的人类培养 CD34+ 衍生红细胞。他们观察到蛋白质组的动态变化。他们采用 CRISPR/Cas9 筛选靶向 HUDEP2 培养系红细胞成熟过程中的激酶，发现靶向 c-Kit/MAPK 信号传导可促进终末红细胞成熟。作者做了大量工作，功能方法合理。揭示人类红细胞成熟过程中的蛋白质组动态变化是主要关注点。 MAPK 是一种已知的红细胞增殖调节剂，可阻止小鼠和人类红细胞的成熟（相关文献包括 PMID：15705783；17317860；PMID：15166036；PMID：12969966；PMID：31413092；PMID：15030167）。作者应引用这些文献，并阐明他们在红细胞成熟过程中发现 MAPK 的新颖性，或在已知背景下讨论其工作的确认性方面。此外，如果作者能够在 MAPK 信号蛋白敲除小鼠模型的红细胞生成背景下讨论他们的研究结果，那将是有益的。同样，作者应该参考由红细胞生成素受体信号诱导的 PIM1 激酶的研究（PMID：28732065，PMID：20639905），并在该背景下讨论他们的工作。作者鉴定出在红细胞成熟过程中表达的大量 SLC（溶质载体）转运蛋白。这是一个有趣的发现，证实了之前的转录组分析（也应该参考）。如果作者提供有关人类红细胞中 SLC 的功能信息，那将很有趣。
生物反馈干预对焦虑调节有效性的综合模型：观点
生物反馈已被证明是一种有前途的焦虑治疗工具；然而，到目前为止，一些理论和实践上的限制阻碍了它的广泛应用。随着当前技术的进步和人们对使用自我监测技术改善心理健康的兴趣日益浓厚，我们认为现在是启动新一轮生物反馈训练的理想时机。在这篇观点论文中，我们反思了生物反馈训练的现状，包括被认为可以解释生物反馈有效性的更传统的技术和机制，例如操作性学习和冥想技术的整合，以及内感受意识和生理的变化。随后，我们提出了一个综合模型，其中包括一组认知评估作为生物反馈训练中自适应轨迹的潜在决定因素，例如成长心态、自我效能、控制点和威胁挑战评估。最后，我们根据我们的模型与新兴交互技术提供的机制和机制的整合，提出了一套详细的指导方针，以鼓励使用生物反馈进行新阶段的研究和实施。未来的生物反馈干预措施大有可为，它可以利用可穿戴设备和视频游戏的力量，采用以用户为中心的方式，以一种引人入胜、个性化且有意义的方式帮助人们调节焦虑。
肥胖、代谢综合征和骨关节炎需要综合理解和管理
摘要：骨关节炎 (OA) 是一种影响关节的进行性慢性疾病，可导致疼痛和残疾。与主要将 OA 与衰老联系起来的传统观点不同，最近的理解将其描述为整个关节的多因素退行性疾病。新兴研究强调了 OA 发病机制中的代谢和免疫失调，强调肥胖、血脂异常和胰岛素抵抗在改变关节稳态中的作用。最近的研究越来越多地关注白色脂肪组织 (WAT) 在 OA 中的复杂作用。WAT 不仅发挥代谢功能，而且还通过释放各种脂肪因子在全身炎症中发挥关键作用。这些脂肪因子，包括瘦素和脂联素，与加剧软骨侵蚀和促进关节组织内的炎症途径有关。肥胖和代谢综合征的全球危机重叠，严重影响了关节健康。目前已认识到肥胖会导致机械关节超负荷和代谢失调，从而增加罹患骨关节炎（尤其是膝关节）的风险。代谢综合征会诱发慢性炎症并改变关节内的巨噬细胞活性，从而加剧这些风险。肥胖和代谢综合征的多方面影响不仅限于简单的关节负荷。这些疾病通过改变组织组成、促进炎症性巨噬细胞极化和损害软骨细胞代谢来破坏正常的关节功能。这些变化会促进骨关节炎的进展，凸显出需要针对该疾病的机械和生化方面的针对性治疗策略。最近对骨关节炎分子通路的了解进展表明了潜在的治疗靶点。调节巨噬细胞极化、改善软骨细胞功能或使脂肪因子水平正常化的干预措施可以作为预防或改善疾病的疗法。探索饮食、运动和药物干预在调节这些通路中的作用，为减轻骨关节炎的负担提供了有希望的途径。此外，这些方法可以证明具有成本效益，并可避免增加医疗保健的机会。
SRGAP2的人类特异性旁系同源于诱导新苯二醇特征 2025.01.29.634372.full.pdf
图1：可编程医学框架的概述，该框架将多种多样和临床数据与文献支持的疾病知识图，宠物建模管道和Geneterrain分析相结合。该过程始于基因组的疾病基因策略，包括遗传变异，差异表达和药物靶标（步骤0-1）和知识图构造（步骤2），然后进行宠物模型产生（步骤3）和参数优化（步骤4）。然后，将优化的模型用于宠物实验（步骤5），以预测新型的治疗靶标，最终导致Geneterrain知识图的产生（步骤6），以全面可视化多量表疾病机制和药物效应。这种综合方法旨在完善目标发现，指导药物重新利用和加速临床翻译。
通过综合功能基因组1
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。永久性。预印本（未经Peer Review认证）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以在2025年2月25日发布的此版本中显示此版本的版权所有。 https://doi.org/10.1101/2025.02.23.25322727 doi：medrxiv preprint
通过多目标优化的蛋白质序列设计的整合方法
图1。进化多目标优化为多层设计提供了合适的框架。在这项工作中，我们研究了如何通过多物镜优化方法将机器学习模型（例如PMPNN，AlphaFold2/af2rank和ESM-1V）直接集成到蛋白质序列设计中，称为非主体分类遗传算法II（NSGA-II）。左：首先，通过突变操作员提出了新的设计候选。在这里，该操作员由ESM-1V组成，ESM-1V用于对残基位置进行排列，以及用于重新设计最小Nativelike-NativelikeTose的ProteinMPNN（PMPNN）。中间：然后使用源自AlphaFold2和PMPNN置信度指标的目标函数对设计候选者进行评分。右：最后，得分的候选人被分类为连续的帕累托阵线（这里编号为F1至F5），NSGA-II从最佳战线中选择了最佳战线的候选人。为了证明该框架的有效性，我们对RFAH的多层设计问题进行了深入的分析，RFAH是一种小的折叠式蛋白质，其C末端结构域可以在全-αRFAHα状态和全βrfahβ状态之间互连。在中间面板的两个RFAH状态的卡通表示中，以绿色表示可设计的位置（残基119至154）；请注意，N端结构域在RFAHβ态的带状表示中未显示（请参见方法）。
释放共享经济中混合商业模式的潜力：综合回顾与分析
摘要 本研究在对混合商业模式 (HBM) 和共享经济 (SE) 文献的回顾和综合的基础上，提出了共享经济背景下的 HBM 概念框架。本研究阐明了 HBM 领域内的关键研究主题，涵盖价值主张、治理和协调、资源配置、可持续性、声誉建设、沟通渠道和关键共享生态系统合作伙伴。这些模型整合了访问、平台和社区经济等对 SE 动态至关重要的元素。这种整合代表了两种方法的最佳之处，创建了平衡的战略并加强了整体业务运营。本研究确定并概述了管理影响，包括管理者利用信息技术促进发展的必要性。
1型糖尿病的学龄前儿童父母面临的负担：综合评论
目的：本研究研究了有关诊断为1型糖尿病的学龄前儿童父母的负担的文献。方法：我们基于Whittemore和Knafl的框架进行了一种综合审查方法。文献搜索是使用四个电子数据库的系统评价和荟萃分析的首选报告项目进行的：PubMed：PubMed，Web of Science，护理相关健康文献（CINAHL）和Psycinfo的累积指数。最终，审查中包括18篇文章。结果：审查产生了四个主题：（1）父母负担，（2）与负担有关的因素，（3）应对策略以及（4）对临床实践的影响。父母由于孩子的糖尿病照顾而经历了心理，身体和社会负担。几个因素影响了负担，包括与儿童相关的特征，例如年龄，糖尿病的严重程度和住院经验，以及家族收入，种族和住宅区等父母因素。当孩子被诊断出患有1型糖尿病时，父母最初会感到负担重，但是随着时间的流逝，他们经常通过支持和分担责任来适应情况。父母需要教育和干预措施，以反映学龄前儿童的独特特征。结论：这项综合文献综述表明，当父母被诊断出患有糖尿病时，父母会承受许多负担。未来的研究应着重于制定干预措施，以应对父母的心理困难，包括跟踪父母的心理变化。还应向学龄前儿童的父母提供量身定制的护理干预措施，而不是传统上在临床环境中所有年龄段的儿童群体中采用的更通用的护理干预措施。