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组织清除技术的最新进步为研究人员提供了无与伦比的机会,可以在细胞分辨率下探索整个小鼠大脑。随着这种实验技术的扩展,需要有效分析和集成全脑映射数据集的可扩展且易于使用的计算工具。到此为止,我们在这里提出了Cupic-Cloud,这是一个基于云的框架,旨在量化,可视化和集成整个鼠标脑数据。Cubic-Cloud是一个完全自动化的系统,用户可以在其中上传其全脑数据,运行分析并发布结果。我们通过多种应用来证明立方云的通用性。首先,我们研究了PV,SST,CHAT,TH和IBA1表达细胞的大脑范围分布。第二,对AD模型小鼠大脑中的β斑块沉积进行了定量。第三,我们通过C-FOS免疫染色在LPS诱导的炎症下重建神经元活性。最后,我们通过伪型狂犬病病毒显示了整个大脑的连通性映射。共同提供了一个集成平台,以推动可扩展和协作的全脑映射。

Cubic-Cloud:针对社区驱动的全鼠脑映射的综合计算框架

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