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由于癌症免疫疗法引起的免疫相关事件：免疫机制和临床表现
中心体是无膜细胞器，通过充当Mi-Crotubule组织中心来策划各种生物学功能。在这里，我们报告说，caspase-2驱动的细胞凋亡是在失败的cy- Tokinesis失败的血细胞中引起的，并且需要额外的中心体来触发这种细胞死亡。caspase-2的激活取决于Piddosome多蛋白复合物，而PIDD1在额外的中心体上的启动对于途径激活是必需的。因此，其中心体适配器ANKRD26的损失允许细胞存活和无限制的多酶化，以响应细胞因子衰竭。从机械上讲，细胞死亡是通过caspase-2介导的Bcl2家族蛋白出价的加工来开始线粒体上游的，驱动Bax/Bak依赖性的线粒体外膜透化（MOMP）。值得注意的是，竞标细胞通过参与caspase-2引发的p53依赖性促凋亡转录反应来实现凋亡。始终如一，出价和MDM2作为共享caspase-2底物的作用，而竞标受到动力学偏爱。我们的发现证明了中心体的lim-通过诱导piddosome驱动的线粒体细胞凋亡，以避免避免致病性的多倍体化事件，从而通过其自身的外部重复。
p53 在乳腺癌进展中的作用
转录因子 p53 是多种细胞过程的重要调节因子。在存在基因毒性应激的情况下，p53 被激活以促进 DNA 修复、细胞周期停滞和细胞凋亡。在乳腺癌中，p53 的肿瘤抑制活性经常因其负调节因子 MDM2 的过度表达或突变而失活，30-35% 的乳腺癌病例都存在突变。值得注意的是，乳腺癌中 p53 突变的频率高度依赖于亚型，大多数激素受体阳性或管腔亚型保留野生型 p53 状态，而激素受体阴性患者主要携带 p53 突变，具有获得功能致癌活性，导致预后较差。因此，针对不同乳腺癌亚型中的野生型和突变型 p53 的双管齐下策略可能具有临床意义。近年来，基于 p53 的疗法发展迅速，包括独特的小分子化学抑制剂、钉合肽、PROTAC，以及使用载体和工程抗体的几种基于基因的方法。在这篇综述中，我们重点介绍了处于临床前和临床开发阶段的治疗策略，以克服野生型和突变型 p53 乳腺肿瘤中的 p53 失活，并讨论了它们在临床前和临床环境中的功效和局限性。
使用连接图识别潜在的抗 COVID-19 活性药物
药物再利用可以成为紧急应对严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-COV-2)（冠状病毒病 19 (COVID-19) 大流行的病原体）的一种有趣策略。为此，我们应用连接图谱 (CMap) 生物信息学资源来识别在 CMap 数据库中生成与 SARS-COV-2 GEP 负相关的基因表达谱 (GEP) 的药物，预计这些药物可以在细胞、组织或生物体水平上拮抗病毒的有害影响。我们确定了几种靶向 p53 通路或信号蛋白中的 MDM2 的抗癌化合物：Ras、PKB β、一氧化氮合酶、Rho 激酶，它们都参与增殖和生长信号的传递。我们假设这些药物可能会干扰受感染细胞中生物质合成的高速率，这是癌细胞共有的特征。已知其他化合物（包括乙莫克舍、三甲胺-c、PTB1-IN-3）可通过激活 AMPK 来调节脂质代谢或促进分解代谢反应。分析还发现了四种不同的抗炎分子，包括地塞米松、氟米龙和胞孢酮-b，它们靶向糖皮质激素受体、环氧合酶或 NUR77。这些结果代表了表征治疗 SARS-COV-2 的潜在重新定位策略的第一步。
p53 作为胃肠道间质瘤的生物标志物和潜在靶点
KIT 和 PDGFRA 在胃肠道间质瘤 (GIST) 的致癌过程中起着重要作用，小分子已被用于靶向这种癌症中的 KIT 和 PDGFRA 通路并取得了巨大成功。然而，大约 10% 的 GIST 患者对目前的靶向药物治疗有抗药性。有必要探索其他潜在靶点。尽管 p53 变异在大多数癌症中经常发生，但关于 GIST 中 p53 的研究却很有限。CDKN2A/MDM2/p53 轴调节细胞周期进程和 DNA 损伤反应，进而控制肿瘤生长。该轴是从低风险到高风险 GIST 转变所需的主要事件。通常，p53 突变在 GIST 中并不常见，但据报道 p53 过表达与高风险 GIST 和不良预后有关，这意味着 p53 应该在 GIST 中发挥关键作用。此外，Wee1 还调节细胞周期，据报道，Wee1 抑制的抗肿瘤活性依赖于 p53 突变体。此外，据报道，Wee1 通过调节 KIT 蛋白在 GIST 中具有潜在活性，这种机制可能依赖于 p53 状态。在本文中，我们回顾了以前关于 p53 在 GIST 中的作用的报告，并提出针对 p53 通路作为 GIST 的一种新的额外治疗策略。
IJMS-25-08568（1）.pdf
摘要：神经内分泌肿瘤（NENS）是一组具有共同表型的恶性肿瘤，但预后有所不同，对当前治疗的反应有所不同。基于它们的形态特征和增殖速率，可以将NEN分为两个主要组，具有不同的临床行为和对治疗的反应：（i）良好的分化神经内分泌肿瘤（网络）或类癌（较低的增殖率），以及（ii）较差的小细胞或大细胞神经（II）（ii）（II） 速度）。对于某些NEN（例如胰腺肿瘤，高级肿瘤以及患有DNA损伤修复缺陷的肿瘤），化学疗法是主要的治疗方法。在不同的化学疗法剂中，顺铂和卡铂与依托泊苷结合使用，与网络相比，在治疗NEC方面表现出最大的功效。顺铂和卡铂的细胞毒性作用主要是由于它们与DNA的结合，这会干扰正常的DNA转录和/或复制。与此相一致的是，NEC通常在DNA修复中涉及的途径中具有突变（例如RB，MDM2，BRCA和PTEN），对基于铂的化学疗法具有很高的反应。识别影响NENS引发和进展的分子途径的突变对于预测对铂化学疗法的反应至关重要。本综述旨在强调可靶向的突变，这些突变可以作为对NENS基于铂的化学疗法的治疗反应的预测指标。
认可参数列表 Oncoscreen Jena v5.xlsx
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组：AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
顺铂诱导非小细胞肺癌化疗耐药的分子机制
摘要：癌细胞利用多种机制来提高其存活率和进展率以及对抗癌疗法的抵抗力：通过获得生长因子独立性来解除生长调节途径的管制、免疫系统抑制、减少激活 T 淋巴细胞的抗原表达（拟态）、诱导抗凋亡信号以对抗药物的作用、激活多种 DNA 修复机制并驱动药物从细胞质中主动流出，以及通过微小 RNA (miRNA) 进行表观遗传调控。由于肺癌通常诊断较晚，因此它仍然是五年生存率较低的主要恶性肿瘤；当被诊断出来时，癌症通常已经非常晚期，癌细胞可能已经获得耐药性。本综述总结了顺铂耐药性的主要机制以及顺铂耐药癌细胞与肿瘤微环境之间的相互作用。它还使用 GSE108214 基因表达综合数据库分析了顺铂敏感型和非顺铂耐药型非小细胞肺癌 (NSCLC) 细胞模型的基因表达谱变化。它描述了一个蛋白质-蛋白质相互作用网络，该网络表明 TP53、MDM2 和 CDKN1A 基因高度失调，因为它们编码了可能与顺铂耐受性有关的顶级网络蛋白，这些蛋白在顺铂耐药细胞中均被上调。此外，它通过基于 KEGG 通路分析检查顺铂耐药型 NSCLC 细胞中存在的失调通路的多样性，说明了顺铂耐药性的多因素性质。
靶向蛋白质的环状肽的设计 -
摘要：近年来已经确定了超过930,000个蛋白质蛋白质相互作用（PPI），1个，但它们的理化特性与常规药物靶标有所不同，这使使用2种常规小分子作为模态复杂化。环状肽是靶向3种蛋白质蛋白相互作用（PPI）的一种有希望的方式，但是很难预测靶蛋白4环状肽复合物的结构或设计使用5个计算方法与靶蛋白结合的环状肽序列。最近，具有环状偏移的Alphafold已启用了预测环状肽的结构6，从而实现了从头环状肽设计。我们开发了一个环状肽7复合物的偏移，以实现靶蛋白和环状肽络合物的结构预测，而8种具有环状肽络合物复合物偏移量的Alphafold2可以高精度预测结构。我们9还将环状肽复合物的偏移量应用于Afdesign的粘合剂幻觉方案，即使用Alphafold的10新蛋白设计方法，我们可以设计高预测的局部距离11差异测试和比天然MDM2/P53 12结构的单位界面区域的分离差异11差异测试和较低的分离结合能。此外，该方法被应用于其他12种蛋白质肽复合物和13个蛋白质蛋白质复合物。我们的方法表明，可以设计针对PPI的假定环状肽14个序列。15
Blessed 的三年结果：扩大了 DeltaRex-G 对中型晚期胰腺癌和肉瘤患者（NCT0409）的使用范围
迫切需要创新疗法来应对癌症的根本驱动因素，以抵消进行性转移性疾病必然导致的致命后果。执行细胞周期激活和控制机制的缺陷是近端致癌驱动因素之一，因此针对失调的细胞周期控制元件已成为主要的调控主题和治疗策略（ Gordon 等人，2018 年）。介入性细胞周期抑制剂疗法，例如 DeltaRex-G — 一种肿瘤靶向逆转录载体，编码细胞周期蛋白 G1（CCNG1 致癌基因）的杀细胞“显性负”（dnG1）表达构建体；dnG1 表达阻断细胞周期蛋白 G1/Cdk/myc/Mdm2/P53 轴的细胞活化、转录控制和存活功能。 DeltaRex-G 已被证实能够在存在或不存在功能性 p53 基因座（TS53 肿瘤抑制基因）的情况下诱导增殖性肿瘤细胞和支持性新生血管的凋亡，在多种肿瘤类型中表现出广泛的临床效用。DeltaRex-G 已在全球 280 多名癌症患者中进行了 1 期和 2 期研究，在包括胰腺癌、骨肉瘤、软组织肉瘤、乳腺癌和 B 细胞淋巴瘤在内的难治性转移性癌症患者中诱导长期（> 10 年）存活率（Kim 等人，2017 年；Al-Shihabi 等人，2018 年；Gordon 等人，2018 年；Liu 等人，2021 年）。因此，建议对 DeltaRex-G 进行进一步的临床开发和扩大其可及性，以用于几乎没有或完全没有治疗选择的癌症患者。
神经肿瘤学 - neurooncology.cz
摘要 成人胶质瘤、神经胶质细胞和神经元肿瘤患者的主要治疗方法是手术、放疗和化疗相结合。对于许多全身性癌症，靶向治疗是标准治疗的一部分，然而，大多数这些靶点在中枢神经系统 (CNS) 肿瘤中的预测意义仍未得到充分研究。尽管如此，越来越多的人开始使用先进的分子诊断技术来识别潜在的靶点，并且已获得针对中枢神经系统肿瘤中也存在的靶点的肿瘤无关监管批准。这就提出了一个问题：何时以及针对哪些靶点对成人中枢神经系统肿瘤患者进行测试是有意义的。本指南以证据为基础，回顾了针对成年胶质瘤、胶质神经元和神经元肿瘤患者的 RAS/MAPK 通路（BRAF、NF1）、生长因子受体（EGFR、ALK、成纤维细胞生长因子受体 (FGFR)、神经营养性酪氨酸受体激酶 (NTRK)、血小板衍生的生长因子受体 α 和 ROS1）、细胞周期信号传导（CDK4/6、MDM2/4 和 TSC1/2）和基因组稳定性改变（错配修复、POLE、高肿瘤突变负荷 (TMB)、同源重组缺陷）的靶向治疗的现有证据。目前，BRAF p.V600E 变异的靶向治疗将被视为复发性胶质瘤患者标准治疗的一部分，目前正在等待监管部门的批准。对于已获批的 NTRK 融合和高 TMB 肿瘤无关疗法，其对中枢神经系统肿瘤成年患者的疗效证据非常有限，最好在前瞻性临床登记和试验中进行治疗。对于 FGFR 融合或突变的中枢神经系统肿瘤的靶向治疗，正在进行临床试验以确认迄今为止在篮子试验中观察到的适度活性。对于所有其他已审查的靶向治疗，目前缺乏对中枢神经系统肿瘤有益的证据，应在可用的临床试验背景下进行测试/治疗。