方案 1:将富含 C 的 ssDNA 与 CD 结合并在中性 pH 下形成水凝胶以封装 Dox 的方案。通过将溶液的 pH 从碱性变为中性,实现了 CD-DNA 混合水凝胶的可视溶胶-凝胶转变。研究了药物从水凝胶中体外时间和 pH 依赖性释放曲线。虽然发现水凝胶在正常生理 pH 下可稳定一个月,但在与肿瘤微环境相关的酸性 pH 下,药物分子在 10-11 天内完全溶解并持续释放。对 HeLa 细胞进行的细胞活力测定表明,由于酸性 pH 有利于水凝胶破裂,在载有 Dox 的混合水凝胶存在下,它们被有效缓慢杀死。
重新组合提供了对任何DNA序列进行快速,精确和廉价的遗传改变的能力,无论是在染色体中还是克隆到载体上,以在大肠杆菌(或其他重新组合的培养细菌)中复制的载体,并以高效的方式进行。可以在重新组合的几天内创建不可能用体外基因工程制造的复杂遗传构建体。与单链DNA(ssDNA)重新组合可用于创建单个或多个聚类点突变,小或大(最大或最大(最高10KB)缺失)以及小(10-20个基本)插入(例如序列标签)。使用优化的条件,可以使用如此高的频率进行点突变,以至于无需选择就可以找到它们。这项技术在创建定向和随机突变方面表现出色。
b'sandwich排列,其中包含捕获目标 - 信号探针。随后通过监测观察到的亚甲基蓝(MB)的峰值电流变化来检测所得的DNA杂交事件,该峰值电流变化被用作氧化还原物种,并实现了35 AM的检测极限。Wang等。 [5]基于RGO和锰四苯基孢子的A \ XCF \ X80-偶联结构的自组装纳米复合材料开发了DNA生物传感器,导致6 \ xc3 \ x9710 14M的检测极限,在另一项研究中,在另一项研究中,Ye等。 [6]采用了一个转导界面,该界面由捕获的DNA序列,Aunps和Thionines在玻璃碳电极上官能化RGO来构建无标记的DNA生物传感器,并获得了4.28 \ xc3 \ x9710 199的检测极限。 Chen等。 [7]还基于由氧化铜纳米线和羧基官能化的单壁碳纳米管(SWCNT)组成的杂化纳米复合材料(SWCNTS)开发了特定的序列DNA检测。 DNA检测是通过循环伏安法和3.5 \ xc3 \ x9710 15 m的检测极限。 Zhou等。 [8]使用化学上的RGO电极通过差分脉冲伏安法对ssDNA和dsDNA中的四个DNA碱基的无标记电化学检测进行了。 他们达到了2.0 \ XCE \ XBC M的检测极限,线性浓度范围为0.01至10 mm。 在另一项研究中,Zhang等人。 [9]为特定序列检测制造了无标记的DNA传感器。Wang等。[5]基于RGO和锰四苯基孢子的A \ XCF \ X80-偶联结构的自组装纳米复合材料开发了DNA生物传感器,导致6 \ xc3 \ x9710 14M的检测极限,在另一项研究中,在另一项研究中,Ye等。[6]采用了一个转导界面,该界面由捕获的DNA序列,Aunps和Thionines在玻璃碳电极上官能化RGO来构建无标记的DNA生物传感器,并获得了4.28 \ xc3 \ x9710 199的检测极限。Chen等。 [7]还基于由氧化铜纳米线和羧基官能化的单壁碳纳米管(SWCNT)组成的杂化纳米复合材料(SWCNTS)开发了特定的序列DNA检测。 DNA检测是通过循环伏安法和3.5 \ xc3 \ x9710 15 m的检测极限。 Zhou等。 [8]使用化学上的RGO电极通过差分脉冲伏安法对ssDNA和dsDNA中的四个DNA碱基的无标记电化学检测进行了。 他们达到了2.0 \ XCE \ XBC M的检测极限,线性浓度范围为0.01至10 mm。 在另一项研究中,Zhang等人。 [9]为特定序列检测制造了无标记的DNA传感器。Chen等。[7]还基于由氧化铜纳米线和羧基官能化的单壁碳纳米管(SWCNT)组成的杂化纳米复合材料(SWCNTS)开发了特定的序列DNA检测。DNA检测是通过循环伏安法和3.5 \ xc3 \ x9710 15 m的检测极限。Zhou等。 [8]使用化学上的RGO电极通过差分脉冲伏安法对ssDNA和dsDNA中的四个DNA碱基的无标记电化学检测进行了。 他们达到了2.0 \ XCE \ XBC M的检测极限,线性浓度范围为0.01至10 mm。 在另一项研究中,Zhang等人。 [9]为特定序列检测制造了无标记的DNA传感器。Zhou等。[8]使用化学上的RGO电极通过差分脉冲伏安法对ssDNA和dsDNA中的四个DNA碱基的无标记电化学检测进行了。他们达到了2.0 \ XCE \ XBC M的检测极限,线性浓度范围为0.01至10 mm。在另一项研究中,Zhang等人。 [9]为特定序列检测制造了无标记的DNA传感器。在另一项研究中,Zhang等人。[9]为特定序列检测制造了无标记的DNA传感器。将DNA固定在用石墨烯,Aunps和Polythionine(Pthion)修饰的玻璃碳电极上。通过不同的脉冲伏安法检测到杂交,并且在0.1 pm至10 nm的动态范围内达到了35 fm的检测极限。Bo等人开发了石墨烯和聚苯胺的电化学DNA生物传感器。[10]用于DPV检测辅助DNA序列,并达到了'
CRISPR-Cas9 系统在人类致病菌中富集,并通过未知机制与细胞毒性相关。本文表明,空肠弯曲菌感染人类细胞后,会将其 Cas9 (CjeCas9) 核酸酶分泌到细胞质中。接下来,天然核定位信号使 CjeCas9 进入核,在那里它催化金属依赖性非特异性 DNA 切割,导致细胞死亡。与 CjeCas9 相比,化脓性链球菌的天然 Cas9 (SpyCas9) 更适合向导依赖性编辑。然而,在人类细胞中,天然 SpyCas9 仍可能造成一些 DNA 损伤,很可能是因为其 ssDNA 切割活性。这种副作用可以通过用适当的向导 RNA 饱和 SpyCas9 来完全预防,这对 CjeCas9 仅部分有效。我们得出结论,CjeCas9 在攻击人类细胞而不是病毒防御中发挥积极作用。此外,这些独特的催化特性可能使 CjeCas9 不太适合基因组编辑应用。
DNA双链断裂(DSB),以确保基因组稳定性。至关重要的是,必须将DSB末端保持在一起才能及时修复。在酿酒酵母中,两种知之甚少的途径介导了DSB的终端。使用MRE11-RAD50-XRS2(MRX)复合物在物理上桥接DSB末端。另一个要求DSB通过EXO1转换为单链DNA(ssDNA),但桥接蛋白是未知的。我们发现该粘着蛋白,其加载器和SMC5/6用EXO1作用于Tether DSB末端。非常明显的是,寡聚中特异性受损的粘着蛋白未能束缚DSB,从而揭示了粘着蛋白寡聚的新功能。除了姐妹染色单体内聚力的已知重要性外,基于显微镜的微流体实验通过确保DSB终端连接来揭示凝聚蛋白在修复中的新作用。总的来说,我们的发现表明,粘着蛋白的低聚可防止DSB的末端分离并促进DSB修复,从而揭示了粘连在保护基因组完整性中的新型作用和作用。
图1。点击编辑的概述和开发。a,单击编辑器的示意图(CE),它是由RNA程序编程的DNA nickase,DNA依赖性DNA聚合酶和ssDNA绑扎域组成的融合蛋白(例如,嗯,核酸内切酶; Huhe)与导向RNA(GRNA)配对。Click-DNA(clkDNA)模板是一种单链DNA寡核苷酸,它编码底漆结合位点(PBS),聚合酶模板(PT)和Huhe识别位点B,从709序列产生的系统生成树47序列47,描绘了Huains多样性的小型元素,该序列是47个序列。量表表示序列之间的分数相关性。c,与ssDNA分子共价磷酸酪氨酸加合物形成共价磷酸酪氨酸加合物的示意图,其中huhe结合了识别顺序以引发单点样共轭反应。d,逐步点击编辑机制,涉及:(1)DNA目标位点释放非目标链(NTS)3'基因组瓣,(2)NTS laps plap杂交与clkDNA PBS,(3)NTS-NTS-NTS-NTS-PBS连接与DNA依赖性DNA Polimentsion(4)nts-pbs intthers(3) clkDNA的编码PT,(5)新合成的3'和天然基因组5'襟翼之间的平衡,以及(6)5'-flap裂解,导致编辑结合。e,在HEK 293T细胞中的点击编辑转染的示意图,涉及CE质粒的共转染(Porcine Circovirus 2(PCV2)Huhe Huhe与NSPCAS9(H840A)融合,并从e.coli dna Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA))中, clkDNA和一个(或两个)GRNA质粒(S)。ngrna)针对非编辑链的目标编辑效率。f,g,使用DNMT1 GRNA和带有PBS13-PT12的clkDNA插入或读取突变(Indels)的 f,g, f,g, f,g, f,g, f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g, f,g, f,g, f,g, f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g, f,g, f,g, f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g, f,g, f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g, f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g, f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。 CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即f,g,使用PBS13-PT12编码A +3- 5 cag deletion(使用A +49 nick; Panel f)或rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 grna a +rnf2 gkdna A +3-5 clkDNA A +49-PT12替换(带有+5“ 2b”刻度;面板G)。CE1,CE(PCV2-NSPCAS9(H840A)-ECKLENOW),带有一个GRNA,以指导非目标链刻度; CE1.N2,CE1带有额外的grna来指导刻痕(即
有一系列可用于定量DNA的方法,包括吸光度,琼脂糖凝胶电泳和荧光DNA结合染料。传统方法涉及使用紫外分光光度计测量样品的吸光度。DNA在260 nm附近具有最大吸光度,因此该波长的紫外线通过样品传递。较高水平的吸光度表明样品中存在的DNA浓度更高。此方法的优点是也可以评估DNA的质量;还测量了280 nm处的吸光度以确定蛋白质污染的水平。A 260 /A 280比例表示DNA样品的纯度,值为1.8或更高的纯DNA样品。这种方法的缺点是,单链DNA(ssDNA)和RNA在260 nm处也吸收紫外线,因此可以干扰结果并引起双链DNA(DSDNA)浓度的高估。可用多种紫外线分光光度计,从量化板或比色杯中DNA的传统仪器到纳米旋风等仪器(Thermo
摘要 BLM 是一种多功能解旋酶,在维持基因组稳定性方面起着关键作用。在 DNA 复制和修复的许多步骤中,它处理不同的 DNA 底物,但不处理缺口 DNA。然而,BLM 如何为各种功能做好准备仍然难以捉摸。在这里,使用组合单分子方法,我们发现当施加外部不稳定力时,大量 BLM 确实可以单向解开缺口的 dsDNA。令人惊讶的是,人类复制蛋白 A (hRPA) 不仅确保有限数量的 BLM 在减小的力下逐步解开缺口的 dsDNA,而且还允许 BLM 在完整和缺口的 ssDNA 上易位,从而产生双向解旋模式。这种激活需要 BLM 靶向缺口,并且溶液中存在游离 hRPA,而它们之间的直接相互作用是可有可无的。我们的研究结果展示了 BLM 的新型 DNA 解旋活性,这可能促进其在 DNA 修复中的功能转换。
使用Nebuilder HIFI HIFI DNA组装大师组合(NEB#E2621),Geneart Gibson组装混合物(Thermo Fisher#A46627)和Fifusion Snap组装组合(TAKARBLEBLBLEBLEBLBLEBLEBLEM)(TAKARE MIX)(TAKARA)(TAKARE MIX)(takARe Mix77),使用NEBUILDER HIFI HIFI HIFI GASSINBLY MIX(NEB#E2621),使用线性化载体(30 ng CRISPR核酸酶报告基因DNA)组装。在50°C下进行60分钟或15分钟进行组装反应。2μL组装的混合物被转化为NEB 5-Alpha胜任的大肠杆菌NEB#C2987)。通过PCR进一步筛选20个菌落,以确认插入物的存在。超过95%的从Nebuilder Hifi和Geneart Gibson组装反应中测试的菌落中包含适当的插入物,尽管Geneart Gibson组装产生的菌落较少。融合式快照没有产生任何成功的菌落。nebuilder Hifi DNA组装主混合均优于Geneart Gibson组装和融合式快照组件。
摘要:端粒是专门的结构,在真核细胞中线性染色体的末端发现,在维持基因组的稳定性和完整性方面起着至关重要的作用。它们由重复的DNA序列,ssDNA悬垂和几种相关的蛋白质组成。端粒的长度与人类的细胞衰老有关,维持的缺陷与各种疾病有关。端粒的关键结构基序可保护脆弱的染色体末端。端粒DNA还具有形成各种复杂DNA高阶结构的能力,包括T环,D环,R环,G-Loops,G-Quadruplexes和I-Motifs,在互补的C-rich链中。虽然已经确定了许多端粒上的基本蛋白质,但它们的相互作用和结构细节的复杂性仍未完全了解。这种观点强调了在理解与人类端粒相关的结构方面的最新进步。它强调了端粒的意义,探索各种端粒结构基序,并深入研究端粒和端粒酶的结构生物学。还讨论了有助于保护端粒的端粒环,其拓扑结构和相关蛋白质。