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液体活检方法用于捕捉癌症免疫治疗期间的肿瘤演变和临床结果
摘要 循环游离肿瘤 DNA (ctDNA) 可作为肿瘤负荷的实时生物标记，并能为了解免疫疗法选择压力下癌症分子格局的演变提供独特的见解。追踪 ctDNA 中检测到的基因组变异格局可能会揭示转移级联的克隆结构，从而提高我们对治疗反应分子连接的理解。虽然液体活检可以快速准确地评估免疫治疗期间的肿瘤负荷动态，但单特征 ctDNA 分析无法完全捕捉抗肿瘤免疫反应的复杂性。这强调需要对肿瘤和免疫区进行综合研究，以了解肿瘤清除动力学与抗肿瘤免疫反应质量之间的关系。 ctDNA 检测在接受免疫检查点抑制剂治疗的患者中的临床应用已显示出预测和预后价值，通过检测基因组生物标志物（例如肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性），以及实时监测循环肿瘤负荷和评估早期治疗反应。这些努力凸显了液体活检在选择接受癌症免疫治疗的患者、监测治疗效果、确定最佳治疗持续时间以及最终指导治疗选择和排序方面发挥的新兴作用。免疫肿瘤学领域越来越多的 ctDNA 指导的介入临床试验推动了液体活检的临床转化，标志着液体活检在精准免疫肿瘤学中的实施迈出了关键一步。
RCAD-LTH-SHPD-L1，一种具有增强抗肿瘤免疫力的双基因重组癌腺病毒，可增加淋巴细胞浸润并重塑肿瘤微环境
使用简单的外周血样本来早期诊断癌症，获取有关肿瘤基因组特征的信息，并预测预后和对治疗的反应可能性，使研究人员和临床医生多年来着迷。从周围血液或癌症患者的其他体液中分离和分析循环肿瘤DNA（CTDNA）的技术的改进正在转化在临床上相关的诊断方法中的这一引人入胜的假设。液体活检在肿瘤药物开发和临床护理中的应用不断扩大。液体活检在肿瘤学中的第一次临床应用是检测EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的抗性突变。1 CTDNA测试目前被认为是任何肿瘤类型的肿瘤基因组分析的替代方法。2在患有晚期癌症患者中，CTDNA的存在是公认的负预后因素。3同样，ctDNA的动力学确实与对任何类型的全身疗法的反应（即，靶向治疗，化学疗法和免疫疗法）相关。3–5重要的是，液体活检的应用现在正朝着疾病的早期阶段迈进，从早期诊断到在接受原发性肿瘤手术切除的患者中对最小残留疾病（MRD）的鉴定。美国FDA的Vellanki等人6的评论文章以准确，详细的方式描述了液体活检在精确肿瘤学领域的可能应用。更重要的是，作者强调了从研究仅研究CTDNA测试的应用到临床实践所需的进一步证据，甚至可能将其用作临床试验的早期终点。后一种方法的阀门对于加速新药的批准至关重要。
补充材料
手术获得的原发性肿瘤组织样品和相应的连续血样品，分别获得了体细胞突变筛查和ctDNA监测。使用三组结直肠癌患者（CRC）的三个不同平台对原发性肿瘤进行了测序分析。分别分析了11、27和14例患者的肿瘤样本，分别为1、2和3组。使用Clearseq综合癌症小组（Agilent Technologies，Inc.，Santa Clara，CA）使用Illumina HISEQ 2000 Sequencer（Illumina，Inc。，San Diego，CA）分析集1，该基因针对151个疾病相关的基因（Maintext的参考文献34）。 分别使用ION Proton™和ION S5™系统（Thermo Fisher Scientific，Waltham，MA）分析了集2和3，其定制面板的靶向39个基因，这些基因经常在CRC中改变。 1集1样品在我们的先前研究中进行了分析，该研究考虑了原发性肿瘤的三个区域以及外周血单核细胞（PBMCS）（总共四个样品）的相应DNA，以评估肿瘤内遗传异质性对循环肿瘤DNA DNA（CTDNA）（CTDNA）（参考文本34）的影响。 在该研究中，结果表明，肿瘤遗传异质性并不是CTDNA分析的主要障碍，前提是从肿瘤的单个区域中选择具有足够变异等位基因频率（VAF）的体突变。 本研究中原发性肿瘤测序的最高优先级是检测一些具有高VAF的体细胞突变。集1，该基因针对151个疾病相关的基因（Maintext的参考文献34）。集2和3，其定制面板的靶向39个基因，这些基因经常在CRC中改变。1集1样品在我们的先前研究中进行了分析，该研究考虑了原发性肿瘤的三个区域以及外周血单核细胞（PBMCS）（总共四个样品）的相应DNA，以评估肿瘤内遗传异质性对循环肿瘤DNA DNA（CTDNA）（CTDNA）（参考文本34）的影响。在该研究中，结果表明，肿瘤遗传异质性并不是CTDNA分析的主要障碍，前提是从肿瘤的单个区域中选择具有足够变异等位基因频率（VAF）的体突变。本研究中原发性肿瘤测序的最高优先级是检测一些具有高VAF的体细胞突变。此外，三个肿瘤区域中通常检测到的突变仅限于一组基因，其中包括TP53，APC，KRAS，PIK3CA，FBXW7和BRAF。
初步阶段1 IMM-1-104的安全性和活性，AN ...
黑色素瘤，2个阑尾，1个胆管癌加2其他。评估两种候选最佳剂量240和320 mg QD，支持MAPK途径的DCI。在≥10％的患者中发生的与治疗相关的不良事件（TRAES）是短暂的，并且在观察到时主要限制为1或2级。没有注意到DLT或严重的Traes。尽管未观察到恢复反应和第1阶段的终点，但在异质，大量预处理的晚期转移性患者中有希望的临床活性迹象。配对的CT扫描（40）和ctDNA（36）显示：（1.）27（68％）的SLD <20％，9（23％）的SLDS为0％至-25％，（2。）15（38％）的目标病变回归（-2.0％至-66.7％），（3。）在13例（36％）患者（-3％至-81％）中观察到平均ctDNA减少。（4。）RAS ctDNA中没有新的突变变体和（5.）剂量依赖性抑制ex Vivo Perk 1。
循环肿瘤DNA作为紫veal黑色素瘤肝转移酶的患者的预后因子
目的：我们在这里报告了接受尿中黑色素瘤（UM）肝转移切除术（NCT02849145）的患者中循环肿瘤DNA（CTDNA）检测的前瞻性研究结果。背景：在UM患者中，肝脏是最常见的，通常是转移的部位。肝转移的局部治疗，例如手术切除，可能对选定的患者有益。方法：入学后，有资格接受肝手术的转移性UM患者的血浆样本在手术前后收集。GNAQ / GNA11突变在存档的肿瘤组织中鉴定出来，用于通过液滴数字聚合酶链反应来量化CtDNA，然后与患者的手术结果相关。结果：包括四十七名患者。肝手术与无细胞循环DNA水平的主要增加有关，手术后2天（约20倍）峰值。在40名可评估患者中，14例（35％）在手术前可检测到CTDNA，中位等位基因频率为1.1％。这些患者经历了统计上短的无复发生存
GS3-01：ZEST 中的循环肿瘤 DNA 监测，这是一项针对三阴性乳腺癌患者使用尼拉帕尼或安慰剂的随机、3 期、双盲研究
背景：血浆中的循环肿瘤 DNA (ctDNA) 检测为在完成确定性治疗但仍有分子残留疾病 (MRD) 的患者中识别早期乳腺癌 (BC) 复发提供了机会。ZEST 是一项随机、3 期、双盲试验，旨在评估尼拉帕尼是否可以提高完成治愈性治疗后无放射学复发证据的 BC 和 ctDNA 检测 (ctDNA+) 患者的无病生存率。方法：I-III 期三阴性乳腺癌 (TNBC) 或 BRCA 突变的 HER2- BC 患者符合条件。根据肿瘤组织和匹配的正常血液的全外显子组测序设计了个性化的肿瘤信息 ctDNA 检测 (Signatera)。基于 ctDNA 的 MRD 检测在确定性治疗 (EODT) 结束后的任何时间开始；HR+ 疾病患者可以同时进行内分泌治疗（稳定方案）。根据 ctDNA+ 进行放射学分期。无转移性疾病证据的患者被随机分配（1:1）接受尼拉帕尼（200 或 300 毫克/天，取决于体重和血小板计数）或安慰剂（PBO）。每 12 周进行一次影像学检查。主要终点是尼拉帕尼的安全性；还评估了无病生存期（衡量标准是从随机分组到复发或因任何原因死亡的时间）。
使用循环肿瘤DNA和细胞对卵巢癌进行液体活检：准备好迎接黄金时段了吗？
当直接肿瘤活检由于其侵入性、难以接近性和相关并发症而变得不切实际时，液体活检有可能为癌症患者的预后提供信息并指导治疗决策。具体而言，循环肿瘤 DNA (ctDNA) 和循环肿瘤细胞 (CTC) 作为多种癌症类型的筛查、预测和/或患者监测的伴随诊断生物标志物已显示出良好的效果。在卵巢癌 (OC) 中，CTC 和 ctDNA 分析可以对原发性、转移性和复发性肿瘤进行全面的分子分析。这些生物标志物还与整体肿瘤负担相关，因此，它们为临床过程中的患者监测提供了微创手段，以确定治疗反应并在疾病复发的情况下及时调整治疗。在这里，我们回顾了最近关于 CTC 和 ctDNA 在 OC 中的潜在临床价值的报告，并详细阐述了它们在诊断和预后中的用途。我们批判性地评估当前的证据，并讨论在液体活检在 OC 管理的常规临床实践中实施之前仍需解决的问题。
DNA液体活检的基于癌症相关的静脉血栓栓塞的预测
与癌症相关的静脉血栓栓塞（VTE）是肿瘤成本，发病率和死亡率的主要来源。识别高危患者进行预防性抗凝治疗具有挑战性，并增加了临床医生负担。循环肿瘤DNA（CTDNA）测序测定法（“液体活检”）已被广泛实施，但是它们的VTE预后效用尚不清楚。在这里，我们分析了三个血浆测序队列：一个泛癌发现队列，由4,141例非小细胞肺癌（NSCLC）或乳腺癌，胰腺和其他癌症患者组成；一个前瞻性验证队列，由1,426例具有相同癌症类型的患者组成；以及463例晚期NSCLC患者的国际概括性队列。ctDNA检测与VTE相关，与临床和放射学特征无关。在液体活检数据上训练的机器学习模型的表现优于先前的风险评分（发现，验证和概括性c-Indices 0.74、0.73和0.67，而Khorana分数为0.57、0.61和0.54）。在现实世界数据中，如果检测到ctDNA，则抗凝VTE速率较低（n = 2,522，调整危险比（HR）= 0.50，95％置信区间（CI）：0.30-0.81）； ctDNA-患者（n = 1,619）没有受益于抗凝作用（调整后的HR = 0.89，95％CI：0.40–2.0）。这些结果提供了初步证据，表明除临床参数外，液体活检还可以改善VTE风险分层。需要进行介入的随机前瞻性研究，以确认液体活检的临床效用，以指导癌症患者的抗凝治疗。
NHS Tayside 液体活检的发展：针对胰腺癌和结直肠癌患者的基因血液检测
简体中文摘要 背景和研究目的 目前，对于结直肠癌和胰腺癌，临床决策主要基于两种方式：放射扫描和血液生物标志物（肿瘤标志物），后者针对不同类型的癌症（结直肠癌为 CEA，胰腺癌为 CA19-9）。我们在扫描中看到的内容以及肿瘤标志物的高低决定了每位患者的适当治疗途径，通常包括手术和/或化疗-放疗相结合。然而，由于癌症含有不同类型的突变，患者通常不会像预期的那样对治疗产生反应，而且在放射图像或肿瘤标志物水平上反映出来之前会有明显的延迟。显然，由于现有诊断方式的限制，优化患者治疗的进程一直被耽搁。因此，改善患者护理和结果的关键是打开一扇门，深入了解肿瘤生物学。循环肿瘤 DNA (ctDNA) 是一种无细胞 DNA（遗传物质），源自肿瘤细胞并存在于血液中。液体活检是一种涉及 ctDNA 分析的方法，它提供了一种微创的传统组织活检替代方法。该技术允许通过分析血液样本来检测和监测癌症。这是一项针对新诊断为胰腺癌和结直肠癌的患者的 ctDNA 研究。