。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人(该版本发布于2024年4月6日。; https://doi.org/10.1101/2024.04.04.04.05.588317 doi:biorxiv Preprint
•企业诺替尼(Rinn;也称为Furmonertinib)是一种口服,高度脑胶质且广泛活跃的突变突变 - 选择性表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂,以抗经典和不常见的EGFR突变(Musib等,2022)。•它在中国获得了一线晚期非小细胞肺癌(NSCLC),具有EGFR EXON 19删除或基于第3阶段研究中观察到的无进展生存率(PFS)益处的EGFR EXON DELETION或L858R突变。•目前正在一项全球3阶段试验中对EGFR外显子20插入突变(Furvent; NCT05607550)以及在全球IB研究中评估EGFR或HER2突变患者(包括UNCOSON EGGFR EGFR EGFR突变)的患者的IB研究(包括EGFR或HER2突变)的全球IB研究(NCT05607550)的研究(NCT05607550),以及在全球阶段IB研究中进行研究。•菲尼尔替尼已获得美国FDA突破疗法的名称,用于治疗先前未经治疗的局部晚期或转移性非质量NSCLC患者具有EGFR EXON 20插入突变。•EGFR外显子20插入突变是激活EGFR的不常见EGFR突变,并导致添加1个或更多氨基酸,通常在EGFR激酶结构域内聚集在E762和C775之间,在EGFR激酶结构域中,它改变了药物结合的口袋,以阻碍诸如osimertinibib的药物结合。已经确定了120多种变体(Friedlaender等,2022)。•p-LoopαC-螺旋压缩(PACC)突变代表了不常见的EGFR激活突变(Robichaux等,2021)的另一个子集,这些突变与外显子20插入突变相似,在改变药物结合袋中,并且被发现为单个或单个或化合物EGFR突变。•在这里,我们进一步将PACC突变描述为EGFR突变的NSCLC中的癌症驱动因素,并评估了使用PACC和外显子20插入突变的二诺替尼对突变EGFR的临床前活性和结合机制。
杜氏肌营养不良症 (DMD) 是一种严重的遗传性疾病,其特征是进行性肌肉退化,伴有呼吸和心脏并发症,是由编码蛋白质肌营养不良蛋白的 DMD 基因突变引起的。各种 DMD 突变会导致不同的表型和疾病严重程度。了解基因型/表型相关性对于优化临床护理至关重要,因为突变特异性疗法和创新治疗方法正在变得可用。疾病修饰基因,影响疾病严重程度和表型表现的反式活性变体,可能会调节对治疗的反应,并成为新的治疗靶点。通过广泛的基因组图谱研究发现更多的疾病修饰基因,有可能为患有 DMD 的个体微调预后评估。本综述提供了对基因型/表型相关性和修饰基因在 DMD 中的影响的见解。
干旱基因编码SWI/SNF染色质重塑复合物的亚基,并经常在人类癌症中突变。我们研究了黑色素瘤患者的干旱突变,分子特征和临床结局之间的相关性。皮肤黑色素瘤样品(n = 1577)。在干旱基因(ARID1A/2/1b/5b)中,通过致病/可能的致病突变对样品进行分层。PD-L1表达。肿瘤突变负担(TMB) - - 定义为≥10个突变/mb。转录组特征可预测对免疫检查点抑制剂的反应 - 牙牙γ和T细胞发炎得分。实际总体生存(OS)信息是从保险索赔数据中获得的,从组织收集时间到上次接触日期,Kaplan-Meier估算得出。Mann – Whitney U,Chi-square和Fisher精确测试在适当的情况下应用,P值调整为多次比较。arid2突变更为普遍(11.0%:n = 451 vs 2.8%:n = 113),并同时使用ARID1A / ARID2突变在1.1%(n = 46)样品中。ARID mutations were associated with a high prevalence of RAS pathway mutations— NF1 ( ARID1A , 52.6%; ARID2 , 48.5%; ARID1A/2 , 63.6%; and ARID-WT, 13.3%; p < 0.0001) and KRAS ( ARID1A , 3.5%; ARID2 , 3.1%; ARID1A/2 , 6.5%; and ARID-WT, 1.0%; p = 0.018)),尽管BRAF突变在干旱熔化的队列中不太常见(ARID1A,31.9%; ARID2,35.6%; ARID1A/2,26.1%;和ARID-WT,50.4%; P <0.0001)。tmb-high在干旱突变的样品中更为常见(ARID1A,80.9%; ARID2,89.9%; ARID1A/2,100%; ARID-WT,49.4%; P <0.0001),而PD-L1阳性相似ARID-WT,44.9%; p = 0.109)。与ARID-WT相比,ARID1A突变患者的DMMR/MSI-H患病率更高(2.7%vs 0.2%,P = 0.030)。与ARID-WT相比,在ARID2突出的样品中,IFN-γ和T细胞特征的中值更高(IFN-γ: - 0.15 vs-0.21,p = 0.0066; t-cell:23.5 vs-18.5,p = 0.041)。ARID2突变患者的生存率提高了。 (HR:1.22(95%CI 1.0-1.5),p = 0.022)。与ARID -WT相比,使用抗PD-1治疗的ARID2突变没有观察到其他OS益处。干旱突变患者的黑色素瘤患者表现出与ICI反应相关的标志物的较高患病率,包括TMB-H和免疫相关的特征。我们的数据还表明,与抗PD1治疗无关,ARID2突变患者的生存结果改善。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年3月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.03.22.586207 doi:Biorxiv Preprint
针对RAS途径仍然是精确肿瘤学的圣杯。在胰腺导管腺癌(PDAC)的情况下,癌基因KRAS中的港口突变为90-92%,从而触发了规范的MAPK信号传导。过去没有结合口袋的KRAS蛋白质的平滑结构及其对GTP的亲和力在过去妨碍了药物的发展。KRAS G12C共价抑制剂的出现为瞄准KRAS提供了新的热情。然而,与RAS激活有关的众多途径确实导致了早期抗性的发展。此外,由致癌性KRAS决定的致密基质细分市场和免疫抑制微环境可能会影响治疗反应,从而强调了对基于组合的方法的需求。鉴于KRAS的突变发生在PDAC肿瘤发生早期,因此对其多效性作用的理解是该疾病进展的关键。在此,我们回顾了针对KRA的当前观点,重点是PDAC。
体细胞突变可能在植物进化中起作用,但与植物体细胞突变有关的常见期望仍未得到充分的测试。与大多数动物不同,假定植物种系在发育后期被搁置,这导致人们期望植物会沿生长积累体细胞突变。因此,对躯体突变的命运做出了一些预测:突变在植物组织中的频率通常很低。高频的突变具有更高的代际传播的机会。树的分支拓扑决定了突变分配;暴露于紫外线(紫外线)辐射会增加诱变。为了深入了解植物中突变的积累和传播,我们产生了两个高质量的参考基因组和一个独特的数据集,该数据集的60个高覆盖范围 - 整体 - 基因组序列的两种热带树种,番茄科植物(Fabaceae)(fafaceae)(fafaceae)和sextonia rubra(lauraceae)。,我们在D.圭亚那的D. guianensis中发现了15,066个从头突变,在S. rubra中发现了3,208个,令人惊讶的是,几乎全部都以低频发现。我们证明1)低频率突变可以传输到下一代; 2)突变系统发育偏离树的分支拓扑; 3)突变率和突变光谱并不明显受到紫外线暴露差异的影响。总的来说,我们的结果表明,植物生长,衰老,紫外线暴露和突变速率之间的联系比通常想象的要复杂得多。
结果:我们的第一个至关重要的发现是,除了引起翻译变化的变体外,与饮酒前的饮酒相关的主要遗传变化也称为“沉默突变”和3'未翻译区域(3'UTR)中的突变。这些都没有改变所翻译的氨基酸序列,而是影响基因转录的速率和构象,包括改变基因疗效的稳定性和翻译后事件。这一发现提倡在人类基因组研究中重新聚焦基因效能感的变化。在确定的关键本体论中是“疼痛的伤害感受或感觉感知”,它不仅包含伤害感受(ARRB1,CCL3,EPHB1),而且还伴有钠(SCN1A,SCN1A,SCN2A,SCN2B,SCN2B,SCN3A,SCN3A,SCN7A,SCN7A),SCN7A),SCN99A(SCN9A9A)(kc N9aa)(KC)和POTASS(kc)。
非小细胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌的约85%,其中约15 - 20%的特征是影响表皮生长因子受体(EGFR)的突变。几年来,开发了一类酪氨酸激酶抑制剂,靶向影响EGFR(EGFR-TKIS)的敏感突变。迄今为止,TKIS就业的主要负担是由于抵抗突变的发作。此范围审查旨在恢复有关在癌基因吸收的NSCLC中诱导的电阻机制的体外评估的细胞系模型的当前情况。腺癌结果最多研究的NSCLC组织型,H1650,H1975,HCC827和PC9突变的细胞系,而Gefitinib和Osimertinib是研究最多的抑制剂。总体而言,收集的数据构架了该主题的当前进步,显示了从RNA介导的策略到创新的组合疗法所采用的许多方法来克服TKIS抗性。
谷物宽度和重量2(GW2)是一种E3-泛素连接酶编码基因,对谷物物种中谷物的大小和重量负调节。因此,建议禁用GW2基因活性以提高作物生产率。我们在这里表明,大麦GW2.1同源物的CRISPR/CAS介导的诱变会导致细长谷物的发展和蛋白质含量增加。同时,GW2.1功能的损失引起了由于尖峰数量减少和谷物设置低而引起的明显晶粒屈服不足。我们还表明,GW2.1缺乏作物产量和蛋白质含量引起的相反作用在很大程度上与培养条件无关。这些发现表明大麦GW2.1基因对于产量和晶粒性状之间的优化是必需的。总的来说,我们的数据表明,大麦中GW2.1基因活性的丧失与多效性效应相关,对生成器官的发展以及因此谷物产生产生了负面影响。我们的发现有助于更好地理解谷物的发育以及GW2.1控制大麦的定量和定性遗传改善中控制的UTI。