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SLC30A8 基因座的多种遗传变异影响局部超级增强子活性并影响胰腺 β 细胞的存活和功能
缩写：3C，染色体构象捕获；4C，环状染色体构象捕获；ATAC-seq，使用测序检测转座酶可及染色质；Cas9，来自化脓性链球菌的内切酶；CHIP-seq，染色质免疫沉淀和 DNA 测序；CRISPR，成簇的规律间隔的短回文重复序列；CTCF，CCCTC 结合因子；EXT1，外骨化素糖基转移酶 1；GSIS，葡萄糖刺激的胰岛素分泌；GWAS，全基因组关联研究；MED30，RNA 聚合酶 II 转录亚基 30 的介质；pcHi-C，启动子捕获 Hi-C；R，调控区；RAD21，双链断裂修复蛋白 rad21 同源物；SLC30A8，溶质载体家族 30 成员 8；SNP，单核苷酸多态性； T2D，2 型糖尿病；TAD，拓扑关联结构域；UTP23，UTP23 小亚基加工体成分。
利用现实世界胰腺癌数据集推动药物发现和
胰腺癌是美国与癌症相关死亡的第三大主要原因。当前的治疗选择可提供惨淡的总体生存期，而5年生存期约为12％。对胰腺癌的临床和分子基础的分析对于开发早期检测方法以及新颖的治疗选择至关重要。这种疾病的侵略性和致命性需要开发用于胰腺癌数据的数据存储库和分析系统。胰腺癌动作网络（Pancan）Spark平台是由Velsera提供支持的基于云的数据和分析平台，它从Pancan研究计划中整合了现实世界中的患者健康数据，并通过使胰腺癌数据易于访问和使用来加速研究。涵盖了来自Pancan's New您的肿瘤®（KYT）精密医学服务中600多名胰腺癌患者的临床，成像和基因组学数据，Spark平台与癌症基因组学云（CGC）的公共可用癌症数据相连，也由Velsera驱动。CGC是NCI癌症研究数据共享（CRDC）的一部分，该数据共享（CRDC）是一种基于云的数据科学基础架构，该基础架构将数据与分析工具联系起来，以允许研究人员共享，集成，分析，可视化和推动科学发现。在这里，我们通过提供了一个案例研究来证明这些数据集的应用，该案例研究演示了如何结合和丰富数据以加速胰腺癌研究。目前，可在CRDC上获得的基因组和蛋白质组学数据分别为402例和304例胰腺肿瘤样品。我们将使用SPARK和CGC平台的功能，这些功能为不需要编码知识的多词分析提供了现成的工具。使用KYT和CRDC开放式胰腺癌数据，我们旨在演示如何对来自不同科学领域的数据进行综合分析，并与一个空间中的合作者共享，从而简化并增加了新科学发现的潜力。pancan和CGC数据集的进一步扩展无疑将为胰腺癌肿瘤生物学提供更全面的了解。SPARK和CGC基于云的计算基础架构，以及许多可用的癌症数据集以及易于使用的多派数据处理工作流程和数据分析工具将在此过程中发挥作用。
RAS-GTP抑制胰腺癌
urszula N. Palermo, Marie C. Hasselluhn, Amanda R. Decker-Farrell, Stephanie Chang, Lingyan Jiang, Xing Wei, Yu C. Yang, Ciara Helland, Haley Courtney, Yevgeniy Gindin, Karl Muonio, Ruiping Zhao, Samantha B. Kemp, Cynthia Clendenin, Rina Sor, William P. Vostrejs, Priya S.克鲁格，古兰经A. Timour Baslan，Channing J.der，Mallika Singh＆Kenneth P. Olive
胰腺癌的最佳护理途径
“我为英国胰腺癌的我们汇集了胰腺癌社区的成员，包括拥有生活经验的人，医疗保健专业人员和医疗保健改善专家，以建立对胰腺癌护理的共识。英国的胰腺癌护理生存率令人震惊。，但我们知道这不需要这种方式。我们知道，在接下来的十年中，研究突破将推动这种癌症的变化，但是与此同时，可以做出大量的工作来改善生存并大大改善生活质量。在过去的几年中，我是英国胰腺癌的首席执行官，我从胰腺癌影响的许多人中听到了有关他们获得所需及时，高质量护理所面临的重大挑战。今天，诊断，治疗和护理的质量和速度取决于人们的住所。我们必须并且可以做得更好，这就是为什么我们开发了最佳护理途径的原因。此途径阐明了从诊断，到治疗和护理的地点，对某人的良好护理应该是什么样的。我们已经能够作为一个社区达成共识，即NHS需要加快人们被诊断，治疗和照顾的速度，以使他们有最佳的生存机会和良好的生活质量。我们还需要从英国可用的支持方面看到更大的标准化。但是，为了使胰腺癌的最佳护理途径到处都是现实，我们知道迫切需要政府行动。NHS已经从COVID-19大流行中出来了，我们知道改进将需要更多的资金和能力。这就是为什么我们呼吁英国每个国家的政府投资将其栩栩如生的原因。同时，我们相信本地系统可以做很多事情来进行改进，并在本报告中阐明这些方法。我们分享了某些领域已经发生的事情的示例，并就NHS系统如何开始实施最佳护理途径提出了建议。我们认为，通过共同努力以实现最佳护理途径，我们可以在未来几年内改变胰腺癌的巨大变化。，最终，这将有助于我们对生存率增加一倍的目标取得重大进展，以便更多的胰腺癌患者能够生存长寿。” Diana Jupp胰腺癌英国首席执行官
干扰素是作用于1型糖尿病胰岛上的关键细胞因子
摘要目标/假设促炎细胞因子IFN-α，IFN-γ，IL-1β和TNF-α可能有助于1型糖尿病胰岛炎期间的先天和适应性免疫反应，因此代表有吸引力的治疗靶标可保护β细胞。然而，这些细胞因子中每一种在胰腺β细胞上的具体作用仍然未知。方法我们使用了深度RNA-Seq分析，然后进行了基于逆转录定量PCR（RT-QPCR），蛋白质印迹，组织学和siRNAS的广泛确认实验，以表征人类胰腺β细胞对每个细胞因子对单独的细胞因子的反应，并比较了与iSSET中所产生的签名相比。与IL-1β和TNF-α相比，IFN-α和IFN-γ对β细胞转录组的影响更大。IFN诱导的基因特征与1型糖尿病个体的β细胞中观察到的基因具有很强的相关性，并且特定IFN刺激的基因的表达水平与存在于这些个体的胰岛中的蛋白质正相关，从而调节了β细胞对“危险信号”等病毒感染的反应。锌指NFX1型含有1（Znfx1），一种双链RNA传感器，被IFN高度诱导，并证明在β细胞的抗病毒反应中起关键作用。结论/解释这些数据表明，IFN-α和IFN-γ是人类1型糖尿病的胰岛水平的关键细胞因子，有助于自身免疫性的触发和扩增。
2型糖尿病的多项式多基因机制
胰腺导管腺癌（PDAC）中的摘要尚未发现复发转移特异性突变，这表明表观遗传机制（例如DNA甲基化）是晚期疾病进展的主要贡献者。在这里，我们在小鼠和人类PDAC类器官模型上进行了第一个全基因组纤维纤维测序（WGB），以鉴定特异性和分子亚型特异性DNA甲基化特征。使用这种方法，我们识别了数千种差异化甲基化的（DMR），它们可以区分PDAC的阶段和分子亚型。阶段特定的DMR与与神经系统发育和细胞粘附相关的基因相关，并富含启动子和二价增强子。亚型特异性DMR显示出鳞状亚型中的GATA6前胚层转录网络的过度甲基化和祖细胞亚型中EMT转录网络的过度甲基化。这些结果表明，异常的DNA甲基化构成有助于PDAC的进展和亚型分化，从而产生了具有诊断和预后潜力的显着和重复的DNA甲基化模式。
靶向胰腺癌中的KRAS突变
针对RAS途径仍然是精确肿瘤学的圣杯。在胰腺导管腺癌（PDAC）的情况下，癌基因KRAS中的港口突变为90-92％，从而触发了规范的MAPK信号传导。过去没有结合口袋的KRAS蛋白质的平滑结构及其对GTP的亲和力在过去妨碍了药物的发展。KRAS G12C共价抑制剂的出现为瞄准KRAS提供了新的热情。然而，与RAS激活有关的众多途径确实导致了早期抗性的发展。此外，由致癌性KRAS决定的致密基质细分市场和免疫抑制微环境可能会影响治疗反应，从而强调了对基于组合的方法的需求。鉴于KRAS的突变发生在PDAC肿瘤发生早期，因此对其多效性作用的理解是该疾病进展的关键。在此，我们回顾了针对KRA的当前观点，重点是PDAC。
胰腺癌和胆道癌的治疗耐药性
a 西班牙哈恩大学健康科学系；b 荷兰阿姆斯特丹自由大学医学中心 (VUmc) 阿姆斯特丹癌症中心肿瘤医学系；c 意大利博洛尼亚 IRCCS 博洛尼亚大学医院肿瘤医学系；d 德国卡尔斯鲁厄 Lumobiotics GmbH；e 意大利博洛尼亚大学医学和外科科学系；f 西班牙格拉纳达大学生物医学研究中心 (CIBM) 生物病理学和再生医学研究所 (IBIMER)；g 西班牙格拉纳达格拉纳达大学医院-格拉纳达大学；h 西班牙格拉纳达大学医学院人体解剖学和胚胎学系； i 卓越研究单位“模拟自然”（MNat），格拉纳达大学，西班牙格拉纳达； j 癌症药理学实验室，Fondazione Pisana per la Scienza，比萨，意大利； k 癌症药理学实验室，意大利协会 (AIRC) 启动单位，Fondazione Pisana per la Scienza，比萨大学，比萨，意大利
增强辐射诱导的I型干扰素抗肿瘤免疫反应，通过ATM抑制胰腺癌
引言胰腺癌对免疫疗法难治性（1）。局部晚期胰腺癌的护理标准是多构化疗和化学放疗。尽管在过去十年中进行了全身治疗的改善以及辐射改善局部疾病的能力，但生存仍然很差（2，3）。鉴于当地疾病管理对大多数患者的总体生存和神秘转移性疾病的重要性的重要性，总体生存的进一步改善需要有效的疗法，以针对局部和全身性疾病（4）。辐射可以引起I型干扰素（T1IFN）响应，该反应涉及从微核或胞质双链DNA（DSDNA）中释放受损的DNA。传感细胞质DNA是由循环GMP-AMP（CGA）和干扰素基因（STING）的刺激剂介导的（5，6）。胞质DNA可以通过RNA聚合酶III（poliii）转化为RNA，产生胞质RNA，与线粒体RNA一起通过视黄酸诱导基因I（rig-i-i-i）/线粒体抗生素抗生素抗生素 - 抗生素 - 抗生素 - 抗蛋白质（MAVS）（MAVS）（7）（7）（7）（7）。CGAS/STING和RIG-I/MAVS途径都激活了下流罐结合激酶1（TBK1）和转录因子IRF3，最终导致T1IFN产生（9，10）。最近的研究表明，癌细胞类型和种类（人与小鼠）在辐射诱导的T1IFN表达中的CGA/STING和poliii/rig-i/mavs核酸传感途径的相对贡献（8，11）。尽管我们先前的研究（12）建议