酪蛋白酶水解剂(锥虫),I型使用锥虫类型I类型I用于制备各种培养基,例如无菌测试培养基,诊断媒体和培养基以进行生化特征。摘要和原理胰酮是通过酪蛋白的酶水解获得的。酪蛋白是主要的牛奶蛋白,也是氨基氮的丰富来源。胰酮I型用于支持挑剔的微生物的生长,也适用于发酵研究。存储和稳定存储在紧密闭合的容器中脱水的介质脱水。避免冷冻和过热。在标签上到期日之前使用。打开后,保持粉末状培养基闭合以避免补水。注意:可应要求提供TSE/BSE证书。指示指的是要制备的介质公式中的最终浓度。质量控制测试规格外观浅黄色 /淡黄色棕色粉末。完全溶于水中的溶解度。颜色和清晰度为1%w/v浅黄色,透明溶液。在高压灭菌的15 psi / 15分钟pH值6.12 - 7.02的灰分含量不超过12%的灰分损失(水分含量)不超过5%α-氨基氮含量不超过12%没有金黄色葡萄球菌没有文化反应:细菌在30°C-35°C下孵育18-24小时后观察到的文化特征,在20°C-25°C生物体(ATCC)生长葡萄球菌(6538)良好的ESCHERICHIA(6538)良好的葡萄球菌(873)中真菌的真菌为2-5天。 (9027)良好的链球菌(19615)良好的白色念珠菌(10231)良好的巴西曲霉(16404)好
说明HLA-A/B/C敲除电穿孔套件适用于通过电穿孔的细胞系和原代T细胞工程。该套件既包含Cas9酶(链球菌)和靶向HLA-A/B/C(人白细胞抗原)的GRNA。该套件足以设计高达500万个原代T细胞。背景HLA(人白细胞抗原)-a,b和c是MHC的三种主要类型(主要的组织相容性复合物)1类跨膜蛋白。它们与β2微球蛋白蛋白(由B2M基因编码)形成异二聚体。MHC 1类分子表现出短多肽,通常在长7-11个氨基酸之间,以识别为“自我”或“非自身”的免疫系统。HLA-C存在于所有细胞中,并且由于HLA-C基因的多样性而作为几种单倍型存在。c*08:02代表一种这样的单倍型。HLA I类将新抗原衍生的肽呈现到细胞表面,从而通过TCR(T细胞受体)识别出T细胞的识别。 癌症免疫疗法一直在使用该机制,方法是表达能够识别特定癌症免疫原子的TCR。 在2016年,HLA-C*08:02限制性TIL(肿瘤浸润淋巴细胞)在肺癌中靶向KRAS(Kirsten大鼠肉瘤病毒)G12D突变,导致阳性结果。 在转移性胰腺癌患者中采用了类似的方法,并导致该疾病的消退。 HLA-C*08:02限制性TIL对其他新抗原的TCR的研究可能对癌症治疗有益。 应用程序HLA I类将新抗原衍生的肽呈现到细胞表面,从而通过TCR(T细胞受体)识别出T细胞的识别。癌症免疫疗法一直在使用该机制,方法是表达能够识别特定癌症免疫原子的TCR。在2016年,HLA-C*08:02限制性TIL(肿瘤浸润淋巴细胞)在肺癌中靶向KRAS(Kirsten大鼠肉瘤病毒)G12D突变,导致阳性结果。在转移性胰腺癌患者中采用了类似的方法,并导致该疾病的消退。HLA-C*08:02限制性TIL对其他新抗原的TCR的研究可能对癌症治疗有益。应用程序K562细胞是HLA I和II类负的,使其成为引入和研究特定单倍型响应的理想细胞模型。hla在供体细胞和个体之间的不匹配可以导致免疫排斥反应,一种选择是敲除内源性HLA,从而使细胞被更广泛地普遍使用。
“免疫疗法”的开端可以说可以追溯到古埃及人。,他们像1800年代中期一样,像詹姆斯·佩吉特(James Paget),威廉·布希(Wilhelm Busch)和弗里德里希·费利森(Friedrich Fehleisen)一样,观察到一些癌症患者在感染后经历了肿瘤的消退。到1800年代后期,威廉·科利(William Coley)的“免疫疗法之父”开始进行注射,该注射是由死去的链球菌和塞拉蒂亚·马斯科斯(Serratia Marcescens)组成的,是一种免疫疗法的粗糙形式。他的工作是由他的女儿海伦·科利·瑙斯(Helen Coley Nauts)和劳埃德·旧的。Old致力于杆菌Calmette-guérin疫苗的抗肿瘤作用,并获得了“现代癌症免疫学之父”的名称。如今,免疫疗法的领域已在针对癌症的战争中提供了几支新的军备。这些包括使用单克隆抗体,细胞因子疗法(干扰素-α[IFN-α]和介毒素2 [IL-2]),免疫检查点抑制剂(抗CTLA-4,抗PD1和抗PD-L1),抗PD-L1,癌症/talimoge-pareme-parer-parer-parer-paremoigeNim-paremogogeNim-pare,共刺激性分子和收养细胞疗法(ACT)。建立在基因工程和分子生物学的十字路口上,ACT可以具有各种类型:肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)治疗,T细胞受体(TCR)工程T细胞疗法,天然杀伤剂治疗,或嵌合抗原受体(CAR)T-Cell治疗。其中,汽车T细胞受到了最大的关注,并表现出了最大的希望。在TIL治疗中,从患者的肿瘤活检标本中提取了TIL,然后与暴露于患者肿瘤中存在的新抗原的自体性细胞共培养。tils,使用IL-2在体外扩展,然后将其注入患者。TIL治疗在黑色素瘤,结直肠癌和乳腺癌中表现出了一些希望。 TCR T细胞疗法比TIL治疗的侵入性较小,因为所需的淋巴细胞来自患者的外周血,并且比TIL更加增殖。 提取,纯化和激活后,T细胞为TIL治疗在黑色素瘤,结直肠癌和乳腺癌中表现出了一些希望。TCR T细胞疗法比TIL治疗的侵入性较小,因为所需的淋巴细胞来自患者的外周血,并且比TIL更加增殖。提取,纯化和激活后,T细胞为
水痘是一种全球性高度传染性传染病。1-4 每年,全球约有 420 万人因严重并发症住院。4 在巴西,2012 年至 2017 年期间,报告了 602,136 例水痘病例,共登记与该疾病相关的住院病例 38,612 例,主要影响 1 至 4 岁的年龄组。5 由于原发性水痘-带状疱疹病毒 (VZV) 感染,水痘表现为皮肤和粘膜病变,并伴有非特异性的全身体征和症状。1-3 病变有瘙痒感,具有向心性分布和区域多态性。1,3 最初出现斑点,然后变成丘疹、水疱,后来结痂。1-3 该病是临床诊断。3 通过培养中的病毒分离或通过聚合酶链反应进行确诊。 2 尽管水痘一般是良性的,但它可能导致严重的发病率和死亡率并发症。这些病例在营养不良和免疫功能低下的一岁以下儿童中更为常见。3 化脓性细菌(化脓性链球菌、金黄色葡萄球菌)的皮肤继发感染是最常见的并发症。6 这种类型的感染使患者面临败血症和局部感染(如肺炎)的风险。3 免疫功能低下的患者发生内脏并发症的风险更高(30-50%),如果不进行治疗,死亡率为 15%。2 在儿童中,与中枢神经系统(CNS)相关的并发症是水痘住院的第二大原因。3,6 其他并发症包括:心肌炎、肾炎、关节炎、雷氏综合征、肝炎和眼科病变。 2 保守估计,水痘每年在全球造成 4,200 人死亡。4,7 无论是在接种疫苗前还是接种疫苗后,死亡率都低于其他疫苗控制疾病。8 尽管如此,该疾病对人群产生了重大影响,因为它会给多个人群带来严重后果。因此,采取行动进行预防非常重要。4 如今,许多国家都采用疫苗作为预防水痘的重要策略。9-17 水痘疫苗由 Takahashi 于 1974 年开发,由 Oka 菌株制成的减毒病毒组成。3,9 疫苗血清转化
CRISPR-Cas 系统是原核生物的一种免疫机制,可特异性识别和降解外源核酸,从基因上保护生物体 [1]。CRISPR-Cas 系统的功能分为用于靶核酸识别的向导 RNA (gRNA) 和用于切割的 Cas 核酸酶 [1]。该模块化系统通过修改 gRNA 上的靶标识别序列 (TRS) 来切割所需的核苷酸序列 [2],从而实现跨各种生物体(包括微生物)的基因组编辑 [3, 4]。第 2 类 CRISPR-Cas 系统具有单个效应蛋白,主要用于基因组编辑。值得注意的是,大量研究集中在源自化脓性链球菌 (SpCas9) 的 Cas9 [5]。然而,Cas9 蛋白的异源表达可能导致细胞毒性或异常生长 [6, 7]。因此,内源性 CRISPR-Cas 系统 [8]、Cas9 直系同源物 [9] 和 Cas12 或 Cas13 [10] 被用作编辑工具,以提供与靶细胞更好的兼容性。此外,广泛使用的 SpCas9 的尺寸较大(4.1 kb;1,368 aa),这带来了挑战,特别是在包装到空间有限的病毒载体中时 [11]。微型 CRISPR-Cas12f1 系统因其解决这一挑战的潜力而备受关注。Cas12f1 直系同源物由约 500 aa 的单个多肽组成,这比 Cas9 的长度短得多 [12]。已知 Cas12f1 核酸酶形成二聚体,每个单个 RuvC 结构域切割靶 DNA 的两条链 [13, 14]。 Cas12f1 核酸酶在基因组中用于单基因编辑已被报道在多种生物体中,包括大肠杆菌 [15, 16]、炭疽芽孢杆菌 [17]、肺炎克雷伯菌 [18]、小鼠 [19] 和人类 [20, 21]。最近,在天蓝色链霉菌中证实了 Cas12f1 介导的两个基因同时缺失 [22]。然而,Cas12f1 在精确的多重基因组编辑中的应用尚未有记录。在本研究中,我们尝试使用 CRISPR-Cas12f1 系统在大肠杆菌中进行单核苷酸水平的多重基因组编辑。采用了两种策略——调节细胞恢复温度和修改 gRNA,并评估了它们对多重基因组编辑效率和准确性的影响。
成熟和新兴的基因编辑器 CRISPR–Cas 系统是一种广泛存在的原核生物防御系统,用于防御入侵的噬菌体和外来遗传物质。在自然界中,它们由 (1) 效应模块(在第 1 类 CRISPR 系统中是蛋白质复合物,在第 2 类 CRISPR 系统中是单个效应子)和 (2) 适应模块(将外来序列整合到 CRISPR 阵列中,crRNA 从中表达)组成。由于这些系统是 RNA 引导的,因此可以通过改变 crRNA 的序列重新定位它们,这为可编程基因组编辑工具提供了一个起点,有关此类工具的开发已在其他地方进行了综述 5 – 13 。第一个被设计用于人类细胞的系统是 2 类 CRISPR–Cas9 系统 14、15,其中化脓性链球菌 CRISPR–Cas9 系统 (SpCas9;也简称为 Cas9) 是目前使用最广泛的系统。Cas9 在与向导 RNA(对于 Cas9 来说称为单向导 RNA (sgRNA))互补的靶位点处产生双链断裂 (DSB);在人类细胞中,这些 DSB 可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 修复,这一过程通常会导致基因功能丧失。早期临床数据 16 表明,NHEJ 介导的基因敲除会降低致病蛋白的表达(见相关链接)。靶向的 DSB 也可以通过宿主细胞的内源性同源修复机制进行修复,从而整合由 Cas9 和 gRNA 随附的外源提供的模板 DNA。 Cas9 已被改造以实现其他基因组结果。通过突变 SpCas9 的催化残基(参考文献 17),Cas9 可以转化为可编程的 DNA 结合蛋白,通常称为死 Cas9 (dCas9)。尽管单独使用 dCas9 可以通过阻止 RNA 聚合酶的通过来减少靶基因转录,但 dCas9 与转录抑制因子(例如 Krüppel 相关框结构域 18)或表观基因组修饰因子(例如 DNA 甲基化酶 DNMT3A 19、20)的融合已促成 CRISPR 干扰系统的产生。类似地,dCas9 可通过融合转录激活因子(如 VP64(参考文献 21))或表观基因组修饰因子(如人类乙酰转移酶 p300(参考文献 22)或 TET1 脱甲基酶 19、23)用于靶向转录激活。
(Doudna 和 Charpentier,2014 年)并在图 1a 中以示意图形式显示。许多细菌物种都有 CRISPR 和 Cas 基因座的变体,其中作为基因组编辑工具研究最广泛的变体是 CRISPR-Cas9 系统(Makarova 等人,2011 年)。CRISPR-Cas9 介导的基因组编辑需要一个 Cas9 引导 RNA(gRNA)复合物,其中包含 Cas9、CRISPR RNA(crRNA)和反式激活 CRISPR RNA(tracrRNA)(见框 1:CRISPR 术语)。如前所述,可以通过多种方法将该复合物引入靶细胞(Lino 等人,2018 年;Shi 等人,2021 年)。在 crRNA 的引导下,该复合物与补体 DNA 结合,并伴有侧翼的原始间隔区相邻基序 5 0 -NGG-3 0(对于化脓性链球菌 Cas9)( Chylinski 等人,2013)。Cas9-gRNA 复合物在靶位点诱导双链断裂( Deltcheva 等人,2011;Shah 等人,2013),靶细胞可以通过非同源末端连接 (NHEJ)( Hefferin 和 Tomkinson,2005)或同源定向修复 (HDR)( Liang 等人,1998)进行修复。在 NHEJ 中,断裂的 DNA 链被重新连接,可以直接重新连接,也可以在随机核苷酸插入或缺失后重新连接( Takata 等人,1998)。这通常会导致移码突变和过早的终止密码子,因此,这种机制很容易用于敲除目的蛋白的表达。在 HDR 中,双链断裂是使用姐妹染色单体作为同源模板链来修复的。通过多次交换、DNA 合成和连接,受损链可以得到精确修复(Takata 等,1998)。不用姐妹染色单体作为模板链,而是将含有所需突变或基因盒的外源 DNA 模板以单链或双链 DNA 的形式引入,同源臂在外侧(Chen 等,2011;Radecke 等,2010;Rouet 等,1994)。多年来,越来越多的实验皮肤病学领域的研究利用了 CRISPR-Cas9 工具箱,尽管目前的数量有限,但在过去 5 年中有所增加(图 1 b 和 c 以及表 1)。本综述旨在认识到在人类表皮角质形成细胞 (KC) 中进行的所有 CRISPR-Cas9 工作,以确定在不同人类 KC 细胞来源中可用的最佳实践和成功策略的关键决定因素,同时为未来使用 CRISPR-Cas9 进行研究提供关键考虑,无论是基础应用还是临床应用。
一名 35 岁女性因化脓性链球菌菌血症引起的脓毒症被送入社区医院,经血培养确诊。她因发烧、低血压和心动过速到急诊室就诊。她描述了在就诊前一个月内多次复发性咽炎。最近一次复发包括 3 天的喉咙痛、肌痛和发烧,经验性使用抗生素治疗。她独自住在一个急性风湿热患病率较低的地区。她没有服用任何药物,没有肌肉骨骼不适,也没有近期皮疹或运动障碍病史。在医院,她接受了静脉注射哌拉西林-他唑巴坦、万古霉素和克林霉素治疗。3 天后血培养呈无菌状态。入院三天后,患者出现胸骨后胸痛,心电图检查发现前壁 ST 段抬高,符合前壁 ST 段抬高型心肌梗死的标准(图 1)。她的高敏心脏肌钙蛋白 T 水平为 12 278(正常值 0-14)ng/L,C 反应蛋白(CRP)水平为 376(正常值 < 10)mg/L。她被转至我院接受紧急冠状动脉造影。到院时,患者直立时血压为 66/54 mm Hg,平卧时血压为 92/62 mm Hg。她出现低氧血症,需要吸氧。冠状动脉造影显示没有阻塞性冠状动脉疾病。几个小时后,她出现血流动力学失代偿。我们在心尖听诊听到新的全收缩期杂音,符合二尖瓣返流。我们还在肺部听诊中检测到吸气性啰音、外周水肿和颈静脉压升高,这些都符合急性失代偿性心力衰竭的症状。我们为她插管以治疗低氧性呼吸衰竭,并将她转至心脏重症监护病房。经胸和经食道超声心动图显示左心室 (LV) 大小正常,左心室收缩功能障碍中度(左心室射血分数 30%–35%),右心室大小和功能正常,中度至重度功能性二尖瓣反流,以及二尖瓣瓣叶增厚。仅经食道超声心动图可见二尖瓣上可能有小赘生物。肺动脉导管插入术显示混合分布性和心源性休克的证据,因此我们用正性肌力药物和血管加压药对她进行治疗。此时,我们的诊断是暴发性心肌炎,可能是二尖瓣感染性心内膜炎,以及中毒性
CRISPR/Cas9 系统天然存在于细菌和古细菌免疫系统中 [ 1 ] ;然而,它已被改造用于真核生物,成为获得诺贝尔奖的基因组编辑系统 [ 2,3 ] 。CRISPR/Cas9 系统使用 gRNA 将 Cas9 核酸酶引导至 NGG 原型间隔区相邻基序序列附近的特定靶标。然后,Cas9 切割 DNA,细胞的天然 DNA 损伤修复机制修复双链断裂。在 CRISPR/Cas9 编辑过程中,用于敲除和修饰靶基因的两种主要修复途径是非同源末端连接 (NHEJ) 和同源定向修复途径。当供体 DNA 模板不可用时,NHEJ 是修复双链断裂的主要选择,这使其成为 CRIPSR/Cas9 敲除实验的一个不错选择。核苷酸的丢失和获得是 NHEJ 介导的修复过程中的常见现象,而敲除则来自编码序列的移动。同源定向修复基于供体 DNA 模板的可用性,主要用于编码或非编码序列中的定制基因修饰 [4,5]。CRISPR/Cas9 系统越来越多地用于高级疗法,包括细胞和基因疗法,前景广阔(例如,用于治疗镰状细胞病的 CRISPR 测试)[6,7]。许多用于实现 CRISPR/Cas9 核酸酶 RNA 引导的基因组编辑的商业产品可通过多种递送方式获得。这些产品包括病毒、质粒、mRNA 和 RNP 中编码的 DNA。此外,CRISPR gRNA 可以分为两部分递送,即 crRNA 和 tracrRNA,或作为 sgRNA。多种细菌物种提供 CAS 蛋白选择;常用的一种是化脓性链球菌 Cas9。同样,这些分子进入细胞的方式也有很多,包括病毒载体(如慢病毒和腺相关病毒载体)和化学方法(如脂质、注射和电穿孔)[8,9]。尽管 CRISPR/Cas9 是一种令人兴奋的基因组编辑工具,但在使用 CRISPR/Cas9 编辑细胞后,关于基因组和表型稳定性的纵向数据有限。目前有几份报告提供的证据表明,CRISPR/Cas9 编辑还可能带来其他意想不到的长期变化[10–12]。此外,在选择编辑的细胞亚群时可能会出现遗传瓶颈。因此,对用于细胞和基因疗法等高级疗法的编辑细胞进行表征至关重要,因为这种疗法通常涉及给患者施用编辑过的细胞群[13]。
CRISPR、Cas12a、CPF1、大麦、诱变、单子叶植物、基因组编辑摘要我们报告了首次成功、高效使用大麦中的 Lb Cas12a,并描述了两种新型 Cas12a 变体的开发和应用。总共我们使用二十种不同的指南比较了五种编码序列 (CDS) 变体,包括两种新型变体和两种指南架构,针对 5 种不同的靶基因。我们发现不同 CDS 版本 (0-87%) 和指南架构 (0-70%) 之间的编辑效率存在很大差异,并且表明我们的两个新型 CDS 版本在该物种的测试中大大优于其他版本。我们展示了产生的突变的遗传性。我们的研究结果强调了优化单个物种的 CRISPR 系统的重要性,并可能有助于在其他单子叶植物中使用 Lb Cas12a。正文 毛螺菌科细菌 Cas12a (Lb Cas12a) 可能是继化脓性链球菌 Cas9 (Sp Cas9) 之后植物基因组编辑中第二广泛使用的可编程核酸酶,并且具有一些潜在优势。首先,由于其对 TTTV PAM 的要求与 NGG 的 Sp Cas9 要求不同,它可用于 GC 沙漠,而 GC 沙漠通常存在于内含子、UTR 和启动子区域中。其次,Lb Cas12a 通常比 Sp Cas9 产生更大的缺失,这可能在缺失研究中有用。第三,虽然 Sp Cas9 在靶标的 PAM 近端切割产生平端,但 Lb Cas12a 在 PAM 远端区域切割产生粘端;这两个特征可能解释了使用 Lb Cas12a 实现的基因靶向发生率更高 (Wolter 和 Puchta,2019)。已知在植物中起作用的三种版本的 Lb Cas12a 针对一个大麦靶标进行了测试。首先,是水稻优化的编码序列 (CDS) (Os Cas12a) (Tang et al., 2017);其次是人类优化的 CDS (Hs Cas12a),在双子叶植物中具有功能 (Bernabé-Orts et al., 2019);第三是拟南芥优化的 CDS,包含 D156R“耐高温”突变 (tt At Cas12a) (Schindele and Puchta, 2020)。我们还创建了两个新版本,携带 D156R 突变的 Hs Cas12a (tt Hs Cas12a) 和携带 8 个内含子的 tt At Cas12 (tt At Cas12+int)。这些内含子之前曾显著提高过 Sp Cas9 的效率(Grutzner 2021),因此我们使用相同的在线工具(NetGene2 - 2.42 - Services - DTU Health Tech)在我们的 tt At Cas12+int 设计中为拟南芥选项获得了较高的剪接置信度。
