成熟和新兴的基因编辑器 CRISPR–Cas 系统是一种广泛存在的原核生物防御系统,用于防御入侵的噬菌体和外来遗传物质。在自然界中,它们由 (1) 效应模块(在第 1 类 CRISPR 系统中是蛋白质复合物,在第 2 类 CRISPR 系统中是单个效应子)和 (2) 适应模块(将外来序列整合到 CRISPR 阵列中,crRNA 从中表达)组成。由于这些系统是 RNA 引导的,因此可以通过改变 crRNA 的序列重新定位它们,这为可编程基因组编辑工具提供了一个起点,有关此类工具的开发已在其他地方进行了综述 5 – 13 。第一个被设计用于人类细胞的系统是 2 类 CRISPR–Cas9 系统 14、15,其中化脓性链球菌 CRISPR–Cas9 系统 (SpCas9;也简称为 Cas9) 是目前使用最广泛的系统。Cas9 在与向导 RNA(对于 Cas9 来说称为单向导 RNA (sgRNA))互补的靶位点处产生双链断裂 (DSB);在人类细胞中,这些 DSB 可以通过非同源末端连接 (NHEJ) 修复,这一过程通常会导致基因功能丧失。早期临床数据 16 表明,NHEJ 介导的基因敲除会降低致病蛋白的表达(见相关链接)。靶向的 DSB 也可以通过宿主细胞的内源性同源修复机制进行修复,从而整合由 Cas9 和 gRNA 随附的外源提供的模板 DNA。 Cas9 已被改造以实现其他基因组结果。通过突变 SpCas9 的催化残基(参考文献 17),Cas9 可以转化为可编程的 DNA 结合蛋白,通常称为死 Cas9 (dCas9)。尽管单独使用 dCas9 可以通过阻止 RNA 聚合酶的通过来减少靶基因转录,但 dCas9 与转录抑制因子(例如 Krüppel 相关框结构域 18)或表观基因组修饰因子(例如 DNA 甲基化酶 DNMT3A 19、20)的融合已促成 CRISPR 干扰系统的产生。类似地,dCas9 可通过融合转录激活因子(如 VP64(参考文献 21))或表观基因组修饰因子(如人类乙酰转移酶 p300(参考文献 22)或 TET1 脱甲基酶 19、23)用于靶向转录激活。
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