邀请了国际癌症研究机构(IARC,世界卫生组织,法国里昂)和Ecole Centrale de Lyon(ECL,ECL,法国里昂)的统计和机器学习中的3年博士学位。PHD候选人将加入Mobil项目(多摩师数据集成,以研究生活方式行为与胃肠癌之间联系的生物学机制,这是11个“ Projets Structurant”之一,资助在形状中的Lyon主动性中。在Vivian Viallon(IARC生物统计学和数据集成团队的负责人)和Yohann de Castro(ICJ教授,法国大学的初级成员)的监督下,博士学位候选人将开发和研究高维非线性潜在可变模型的多组合数据。该方法论项目是出于癌症流行病学应用的动机:我们的模型最终将用于欧洲对癌症和营养的前瞻性调查(EPIC)和英国生物银行研究,以表征人类对特定生活方式的代谢反应(例如,习惯性酒精摄入量),同时考虑了这种不分散的可变性。流行病学结果将是增强我们对生活方式可能影响人类健康(尤其是癌症发展的生物学过程)的理解的关键。
来自SCTI003-A细胞系的代表性图像。(a)Stemcell的HIPSC可以与肠球形区分开,并使用STEMDIFF™肠类动物试剂盒(目录#05140)嵌入Matrigel®Domes中,以使其成熟到人肠癌中。可以使用STEMDIFF™肠杆菌生长培养基(目录#05145)来传递和扩展成熟的类器官(在第13天显示)。(b)使用STEMDIFF™背前桥式分化试剂盒(Catalog#08620)(CatalDiff#08620),可以与SCTI003-A区分开染色的DAPI(蓝色),MAP2(MAP2(MAGENTA),NEUN(黄色)和GFAP(CYAN)的神经器官,并与SCTI003-A区分开,并维持STEMDIFF™Neural Organid Organid Organid Organid Orancecodeandenceant(Catean)。(c)hipsc衍生的小胶质细胞具有可见过程和较小的细胞质与核比率,可以通过造血祖细胞中间人使用STEMDIFF™造血量™造血™造血™造血基因(使用Catalog#05310),从而从Stemcell的HIPSC通过造血祖细胞中间产生(catalog#05310),并使用Stemdiff™microgiriation(Catalog#05310),并使用Stemdiff™MicrogliAD(catalog#05310)(Catalog#05310)。 #100-0019/100-0020)。(d)使用STEMDIFF™心室心肌细胞分化试剂盒(目录#05010),可以从SCTI003-A产生心室心肌细胞的单层培养。
摘要:结直肠癌(CRC)是全球重要的健康问题,在全球癌症中排名第二,在癌症中排名第二。虽然只有一小部分CRC病例才能归因于遗传基因突变,但由于体细胞突变,大多数出现。新兴证据表明,肠道菌群营养不良是一个因素,其中聚酮化合酶合酶阳性大肠杆菌(PKS+ E. coli)在CRC发病机理中起关键作用。pks+细菌产生共糖蛋白,这是一种遗传毒性蛋白,对宿主结肠细胞内的DNA产生有害作用。在这篇综述中,我们研究了肠道菌群在结肠癌发生中的作用,阐明了结肠癌产生细菌如何诱导DNA损伤,促进基因组不稳定性,破坏肠道上皮屏障,诱导粘膜炎症,调节宿主免疫反应并影响细胞周期细胞周期动力学。共同促进了有利于肿瘤开始和进展的微环境。了解PK+细菌介导的CRC发育的基础机制可能为大规模筛查,肿瘤的早期检测以及诸如微生物群调节,细菌靶向治疗,检查点抑制Colibactin生产和免疫调节途径等治疗策略铺平道路。
摘要:结直肠癌(CRC)是全球重要的健康问题,在全球癌症中排名第二,在癌症中排名第二。虽然只有一小部分CRC病例才能归因于遗传基因突变,但由于体细胞突变,大多数出现。新兴证据表明,肠道菌群营养不良是一个因素,其中聚酮化合酶合酶阳性大肠杆菌(PKS+ E. coli)在CRC发病机理中起关键作用。pks+细菌产生共糖蛋白,这是一种遗传毒性蛋白,对宿主结肠细胞内的DNA产生有害作用。在这篇综述中,我们研究了肠道菌群在结肠癌发生中的作用,阐明了结肠癌产生细菌如何诱导DNA损伤,促进基因组不稳定性,破坏肠道上皮屏障,诱导粘膜炎症,调节宿主免疫反应并影响细胞周期细胞周期动力学。共同促进了有利于肿瘤开始和进展的微环境。了解PK+细菌介导的CRC发育的基础机制可能为大规模筛查,肿瘤的早期检测以及诸如微生物群调节,细菌靶向治疗,检查点抑制Colibactin生产和免疫调节途径等治疗策略铺平道路。
摘要:本研究通过全面的分子动力学(MD)仿真探讨了新型S-三嗪基于S-三嗪的MMP-10抑制剂的动态行为和结合稳定性。所研究的化合物,称为化合物(i),表现出有效的抗大肠癌活性(HCT-116; IC 50 =0.018μm)。从机械上讲,标题化合物(i)超过了参考MMP抑制剂NNGH对MMP-10(IC 50 =0.16μm),HCT-116细胞中的GSH耗尽(相对折叠降低= 0.81),使用适度的GPX4抑制作用,诱导的脂质过氧化物和1.32相对倍数。使用Gromacs计划进行100 ns进行MD模拟,以评估复合物的均方根偏差(RMSD),均方根均方根波动(RMSF),旋转半径(RG)(RG),溶剂可访问的表面积(SASA),SASA(SASA),配体相互作用网络,触点频率分析,触点和分子机械构成 - 型 - 分子机械范围(MM MM MM),阐明负责其抗直肠癌活性的分子原则。结果表明,化合物(i)在MMP-10活性位点具有稳定且一致的相互作用,该相互作用支持其有前途的抑制作用和在结直肠癌治疗中的前瞻性治疗应用。结直肠癌(CRC)是第三常见的恶性肿瘤,也是癌症相关死亡率的第四大原因。
胃肠道中肠道微生物的共生构成对宿主生理,福祉和疾病病理学的影响。更具体地说,肠道细菌能够与宿主选择的食物中的饮食成分相互作用,从而在本地和系统上传达其有益或不稳定的作用。肠道细菌具有维持健康的肠道微生物组或永久性肠道不平衡的能力,称为肠癌。肠道营养不良在胃肠道病理中既有局部影响,例如肠肠综合征(IBS)和肠道肠病(IBD),以及系统病理,例如II型糖尿病,肥胖症和精神疾病。可以通过肠道轴的机制改变肠道菌群的改变,可以进一步促进精神疾病的发生(例如,微生物代谢产物,神经内分泌系统,免疫系统)。由于暴露于与慢性压力有关的因素(例如学术工作负荷,乡下饮食和粮食不安全感),因此已经证明了精神疾病的风险在大学生中得到了加速(Beiter等,2015)。由于负担能力和可及性,粮食不安全的学生倾向于吸引低营养价值的食物。这些食物含有不健康的脂肪,糖,并且经过加工。这些不健康食品的饮食成分可能会有害改变肠道微生物组,从而导致局部病理和增加精神疾病的患病率。这篇综述的目的是研究肠道菌群在调节肠道轴的机制中了解其影响的生理和生物学作用,这受大学生在大学生中的某些饮食模式的调节。
1. 引言 为了更详细地了解基因多态性及其意义,有必要定义叶酸-蛋氨酸循环和甲基化的概念。叶酸-蛋氨酸循环是确保体内甲基化所必需的。甲基化是向物质中添加甲基以激活它们。甲基化是一个非常重要的过程,它影响基因表达(活性)、解毒-激活肝脏解毒的II期、维持能量代谢、提供膜结构、髓鞘、乙酰胆碱代谢、免疫调节、神经递质代谢-合成多巴胺、血清素、去甲肾上腺素、乙酰胆碱;褪黑激素的合成、衰老(“表观遗传时钟”-DNA甲基化越少,衰老越快),确保各种基因的开启和关闭、DNA分子的复制(加倍)、DNA修复和重组、蛋白质生物合成、DNA分子的保护和恢复。甲基化是清除体内毒素的关键方法。完善的甲基化过程使毒素和重金属更容易被清除,从而降低患癌症的风险。与异常甲基化有关的一些疾病包括:心血管疾病、骨质疏松症、糖尿病、行为障碍、早产、宫颈癌、肠癌和肺癌。甲基化还负责通过控制同型半胱氨酸水平来调节炎症过程。在甲基化障碍的情况下,血液中的同型半胱氨酸水平会升高,从而增加患心血管疾病的风险。甲基化是将甲基基团附着到某些分子上以激活它们的过程。首先,一种非常重要的氨基酸——蛋氨酸进入人体时会
药物再利用,即探索现有药物的新用途,与开发新药物相比具有显著优势。再利用的药物已经经过安全测试,降低了失败的可能性。预先存在的数据和制造知识缩短了流程。开发成本更低,估计为 3 亿美元,而新药的成本为 20 至 30 亿美元。再利用的药物可以在 3 至 12 年内进入市场,而新药则需要 10 至 17 年。总体而言,药物再利用是一种有前途的方法,可以更快、更便宜地开发新疗法。结肠癌治疗面临障碍。传统药物开发速度慢且成本高。本综述强调药物再利用是一种战略解决方案。通过寻找现有药物的新用途,我们可以克服这些挑战。本综述探讨了结肠癌药物再利用的各种方法:网络模型:识别药物与疾病之间的联系。计算机辅助方法:利用软件预测药物-靶标相互作用。机器学习算法:分析大量数据集以发现隐藏的模式。分子对接技术:模拟药物如何与靶分子结合。本综述强调阿司匹林是结肠癌再利用的有希望的候选药物。其潜在益处是阿司匹林可能减缓癌细胞分裂。同时还强调了人工智能和网络建模在药物再利用中的作用。药物再利用为克服结肠癌治疗的挑战提供了一种有希望的策略。通过利用尖端的计算方法和个性化医疗,我们可以为患者开发更有效、更高效的治疗方案。
摘要:已知与肿瘤相关的巨噬细胞(TAM)和与癌症相关的成纤维细胞(CAF)在肿瘤发育和进展中起支持性作用,但它们在结直肠癌(CRC)中的相互作用尚不清楚。在这里,我们研究了结肠癌衍生的CAF对体外和体内TAM分化,迁移和肿瘤免疫力的影响。与单核细胞共培养时,CAF会吸引单核细胞并诱导其分化为M2巨噬细胞。手术切除的人CRC标本和原位移植小鼠肿瘤的免疫组织学揭示了CAF的数量与M2巨噬细胞的数量之间存在相关性。在CRC原位移植的小鼠模型中,用刺激性刺激因子-1受体(PLX3397)的抑制剂处理的M2巨噬细胞的抑制剂(PLX3397)抑制了M2巨噬细胞,并增加了CD8阳性T细胞浸润肿瘤巢。这种治疗对肿瘤生长的影响很小,但将PLX3397与抗PD-1抗体结合起来显着降低了肿瘤的生长。组合疗法后 RNA-SEQ显示出肿瘤免疫的激活。 总而言之,CAF参与CRC肿瘤免疫微环境中M2巨噬细胞分化的诱导和动员,癌症免疫疗法和PLX3397的组合可能代表了CRC的新型治疗选择。RNA-SEQ显示出肿瘤免疫的激活。总而言之,CAF参与CRC肿瘤免疫微环境中M2巨噬细胞分化的诱导和动员,癌症免疫疗法和PLX3397的组合可能代表了CRC的新型治疗选择。
目录3简介6 1。文学概述7 1.1。结直肠癌7 1.1.1。描述和风险因素7 1.1.2。世界和爱沙尼亚的流行率7 1.1.3。发病机理9 1.1.4。遗传背景12 1.2。微生物瘤的重要性13 1.2.1。结直肠癌与微生物瘤的关系14 1.2.2。微生物瘤对肠癌发展的可能影响15 1.3。结肠癌筛查17 1.3.1。爱沙尼亚癌症筛查18 1.3.2。 关注19 1.3.3。 贡献测试中微生物的分析21 2。 实验部分22 2.1。 工作目标22 2.2。 材料和方法论22 2.2.1。 样品的制备23 2.2.2。 根据标准方案24 2.2.3, DNA分离。 DNA与IFOB管24 2.3.4分离。 测序和数据处理25 3.3。 结果25 3.3.1 DNA分离25 3.3.2。 测序和数据处理27 3.3.2。 微生物群落的分析28 3.4。 讨论31摘要34辞职 /摘要35列表36使用的网址43简单许可44 < / div>爱沙尼亚癌症筛查18 1.3.2。关注19 1.3.3。贡献测试中微生物的分析21 2。实验部分22 2.1。工作目标22 2.2。材料和方法论22 2.2.1。样品的制备23 2.2.2。DNA分离。DNA与IFOB管24 2.3.4分离。测序和数据处理25 3.3。结果25 3.3.1 DNA分离25 3.3.2。测序和数据处理27 3.3.2。微生物群落的分析28 3.4。讨论31摘要34辞职 /摘要35列表36使用的网址43简单许可44 < / div>