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识别药物-靶标相互作用 (DTI) 是药物发现和药物重新定位的重要步骤。为了降低实验成本,已经提出了大量用于此任务的计算方法。已经开发了基于机器学习的模型,尤其是二元分类模型来预测药物-靶标对是否相互作用。然而,当前方法的性能仍有很大改进空间。多标签学习可以克服单标签学习带来的一些困难,从而提高预测性能。多标签学习面临的关键挑战是指数级的输出空间,考虑标签相关性有助于克服这一挑战。在本文中,我们通过引入用于 DTI 预测的社区检测方法(称为 DTI-MLCD)来促进多标签分类。此外,我们更新了黄金标准数据集,在该数据集的基础上添加了 15,000 个以上的 DTI 正样本,该数据集自 2008 年以来已被大多数先前发布的 DTI 预测方法广泛使用。所提出的 DTI-MLCD 应用于这两个数据集,证明了它优于其他机器学习方法和几种现有方法。本研究的数据集和源代码可在 https://github.com/a96123155/DTI-MLCD 上免费获取。

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