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腺苷到肌苷的 RNA 编辑和前 mRNA 剪接主要在转录过程中发生并相互影响。在这里,我们使用缺乏两种编辑酶 ADAR(ADAR1)或 ADARB1(ADAR2)之一的小鼠来确定 RNA 编辑对不同组织剪接的转录组范围影响。我们发现 ADAR 对剪接的影响比 ADARB1 高 100 倍,尽管这两种酶都靶向相似数量的底物,并且有很大的共同重叠。一致地,差异剪接区域经常包含 ADAR 编辑位点。此外,催化失活的 ADAR 也会影响剪接,表明 ADAR 的 RNA 结合会影响剪接。相反,ADARB1 编辑位点在差异剪接区域的 5' 处富集。这些 ADARB1 介导的编辑事件中的几个会改变剪接共识序列,因此强烈影响某些 mRNA 的剪接。差异编辑位点和差异剪接位点之间的显著重叠表明,剪接的进化选择受到组织特异性编辑的调控。

ADAR 缺陷会扰乱小鼠组织的整体剪接格局

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