利用我们基于网络的 CellMiner(https://discover.nci.nih.gov/cellminer/)和 CellMinerCDB(https://discover.nci.nih.gov/cellminercdb/)应用程序中的信息,我们确定了 3978 个与药理反应有显著关联的分子事件,这些基因要么是靶标,要么是生物标志物,要么与药物有因果关系。分子事件包括 DNA 拷贝数、甲基化和突变;和转录本;以及 NCI-60 人类癌细胞系的整体或磷酸化蛋白质表达。虽然所有形式的分子数据在某些(基因-药物)配对中都具有参考价值,但发现显著关联的分子事件类型因药物而异。发现某些形式的分子数据比其他形式具有更频繁的显著相关性。领先的是通过抗体测量的磷蛋白(31%),其次是通过微阵列测量的转录本(16%),以及通过质谱或抗体测量的总蛋白水平(14%)。所有其他测量值的范围在 5% 到 11% 之间。当使用具有相同靶标的不同药物以及对相同分子参数进行不同测量时,数据可靠性的结果一致。各种分子参数与药理反应之间的相关性显著性为与每种基因-药物配对具有生物学相关性的参数提供了功能指示,以及测量类型之间的比较。
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