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及早表征与疾病相关的药物靶标可以大大减少由于缺乏安全性或有效性而导致的临床失败。对人体组织进行单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 在疾病分析中变得越来越普遍,从这些数据中获得的见解可能会影响靶标选择策略。虽然使用 scRNA-seq 了解靶标生物学已经很成熟,但单细胞数据在增加候选治疗靶标从研究成功推进到临床的概率方面的影响尚未得到充分表征。受先前关于遗传证据与临床成功之间关联的研究的启发,我们使用了已知药物靶标基因的回顾性分析,以从 scRNA-seq 数据中识别靶标临床成功的潜在预测因素。特别是,我们调查了成功的药物靶标是否与与健康对照者相比,疾病患者中疾病相关组织(细胞类型特异性)或细胞类型特异性过度表达(疾病细胞特异性)。通过分析 30 种疾病和 13 种组织的 scRNA-seq 数据,我们发现两种类型的 scRNA-seq 支持显著增加了基因-疾病对临床成功的几率。我们估计,两者结合起来可以使目标进入 III 期的几率增加约三倍。重要的是,scRNA-seq 分析确定了一个与直接遗传证据互补的大型靶标空间。特别是,scRNA-seq 支持更有可能优先考虑治疗上可处理的基因类别,例如膜结合蛋白。我们的研究表明,scRNA-seq 获得的有关细胞类型和疾病特异性表达的信息可用于识别可处理和疾病相关的靶标,从而提高临床成功的可能性。

人体组织的单细胞 RNA 测序支持成功的药物靶点

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