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将大型 DNA 序列精确插入基因组的技术对于各种研究和治疗应用至关重要。大型丝氨酸重组酶 (LSR) 可以介导多千碱基 DNA 序列的直接、位点特异性基因组整合,而无需预先安装着陆垫,但目前的方法存在插入率低和脱靶活动率高的问题。在这里,我们提出了一个全面的工程路线图,用于联合优化 DNA 重组效率和特异性。我们结合定向进化、结构分析和计算模型来快速识别附加突变组合。我们通过供体 DNA 优化和 dCas9 融合进一步提高了性能,从而实现了同时招募目标和供体。顶级工程 LSR 变体在内源性人类基因座上实现了高达 53% 的整合效率和 97% 的全基因组特异性,并有效整合大型 DNA 货物(测试高达 12 kb),以在具有挑战性的细胞类型(包括非分裂细胞、人类胚胎干细胞和原代人类 T 细胞)中稳定表达。这种合理设计 DNA 重组酶的蓝图使得精确的基因组工程成为可能,而不会产生双链断裂。

利用工程重组酶将位点特异性 DNA 插入人类基因组

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