另一方面,某些微生物可以对宿主产生有益的影响。这些微生物称为共生或互助微生物。共生微生物对宿主没有有害作用,而相互主义的微生物为宿主带来了好处。例如,一些肠道细菌有助于分解食物并提取营养,而另一些肠道细菌产生了可用作能源的短链脂肪酸。微型生物群落在宿主微生物相互作用中起着至关重要的作用。微型生物群落的组成可能会受到各种因素的影响,包括饮食,遗传学和环境暴露。微型生物群落的变化可能会对宿主的健康产生重大影响。例如,肠道微生物群落的改变与各种疾病有关,包括炎症性肠病,糖尿病和肥胖症(Wen L等,2018)(Mao A,2020年)。