抽象的哺乳动物基因组是通过远距离染色质相互作用来组织和调节的。由CCCTC结合因子(CTCF)形成的结构回路,并粘附于基因组中,而增强子在跨广阔的基因组距离上与启动子相互作用以调节基因表达。尽管基因组学和固定细胞成像方法有助于阐明染色质相互作用的许多方面,但时间信息通常会丢失。在这里,我们讨论3D超分辨率活细胞成像(SRLCI)如何解决有关染色质相互作用的染色体形成和溶解的开放问题。我们讨论了SRLCI实验设计,实施策略以及数据解释,并突出相关的陷阱。我们得出的结论是,尽管在技术要求的情况下,SRLCI AP-PARACHES可能会成为动态探测3D基因组结构和功能并研究增强子 - 启动子相互作用和染色质循环的关键工具。
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