抽象蛋白质相互作用网络对于复杂的细胞过程至关重要。然而,在高度专业的细胞和组织中阐明发生的蛋白质相互作用具有挑战性。在这里,我们描述了整个斑马鱼中依赖性生物素标记的新方法的开发和应用。使用有条件稳定的GFP结合纳米病毒将生物素连接酶靶向感兴趣的GFP标记的蛋白,我们使用现有的GFP标记的转基因斑马鱼线显示了组织特异性的蛋白质组学分析。我们证明了这种方法的适用性,称为Blitz(标记的斑马鱼中的生物素标记),在不同的细胞类型(如神经元和血管内皮细胞)中。我们应用了这种方法来识别骨骼肌中洞穴外套蛋白的相互作用。使用此系统,我们为密切相关但功能上不同的cavin4和cavin1蛋白定义了体内肌肉细胞内的特定相互作用网络。