迄今为止,CRISPR基因组编辑技术已用于研究基因功能,人类疾病研究,包括遗传疾病的发病机理,基因治疗,牲畜和作物遗传改善。基因组编辑与遗传修饰不同,因为后者通过稳定的DNA元素的稳定整合而在基因组中产生修饰,而DNA元素并非自然发生。可以使用针对插入位点的基于事件特异性聚合酶链反应(PCR)的方法来鉴定所得生物及其(大多数)产品。基因组编辑等新育种技术使该育种者的工具箱多样化,以在动植物中产生有用的遗传变异性。这些技术中的几种可以引入单核苷酸变化,而无需整合异物DNA,同时在与预期的表型中产生生物体。