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摘要像所有物理系统一样，生物系统受到物理定律的约束。但是，生物化学的数学模型经常忽略能量的保护，导致不现实的行为。基于能量的模型与质量，电荷和能量的保护一致，有可能帮助理解生物组件之间的复杂相互作用，并且随着实验测量和数据库的最新进展，它变得更加易于发展。在本文中，我们激励使用键合图（工程中的建模工具）用于基于能量的建模和介绍，Bondgraphtools，Bondgraphtools，bonggraphtools，这是一个用于构建和分析债券图模型的Python库。我们使用生物化学的示例来说明如何使用BondgraphTools自动化系统生物学中的模型构建，同时保持与物理定律的一致性。
使用BondgraphTools在生物学中分析和模拟基于能量的模型
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