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生物技术、合成生物学和基础研究对多种染色体修饰的需求要求开发新技术。利用 CRISPR SWAPnDROP,我们将基因组编辑的极限扩展到细菌物种之间大规模体内 DNA 转移。其模块化平台方法有助于物种特异性适应,从而在各种物种中实现基因组编辑。在这项研究中,我们展示了 CRISPR SWAPnDROP 概念在模型生物大肠杆菌和目前增长最快、与生物技术相关的生物弧菌中的实现。我们展示了 151kb 染色体 DNA 在大肠杆菌菌株之间以及从大肠杆菌到弧菌的切除、转移和整合,而无需大小限制的中间 DNA 提取。随着大肠杆菌 MG1655 野生型乳糖操纵子的转移,我们在弧菌中建立了功能性的乳糖和半乳糖降解途径,以扩展其生物技术谱。我们还转移了大肠杆菌 DH5 α lac 操纵子,使 V. natriegens 能够进行 α 互补 - 这是朝着超快速克隆菌株迈出的一步。此外,CRISPR SWAPnDROP 旨在成为基因组工程的瑞士军刀。其应用范围包括无疤痕、无标记、迭代和并行插入和删除、基因组重排以及菌株间和物种间的基因转移。模块化特性有利于 DNA 库应用和标准化部件的回收利用。其新颖的多色无疤痕共选择系统显著提高了单次编辑的编辑效率,四次编辑的编辑效率提高到 83%,并在整个组装和编辑过程中提供视觉质量控制。

CRISPR SWAPnDROP

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