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CRISPR-Cas9 技术被广泛用于精确和特异性地编辑酿酒酵母基因组,以获得无标记的工程宿主。靶向双链断裂由向导 RNA (gRNA) 控制,该 RNA 包含用于 Cas9 结合的结构片段和与基因组 DNA 靶标杂交的 20 碱基引导序列。将 20 碱基引导序列引入 gRNA 表达载体通常需要复杂、耗时和/或昂贵的克隆程序。我们提出了一种用于酿酒酵母 CRISPR-Cas9 基因组编辑的新质粒,pCEC-red。该工具可以(i)在单个质粒中将 Cas9 和 gRNA 表达盒转化酵母,(ii)借助 Golden Gate Assembly 将 20 碱基序列高效插入质粒,以及(iii)进行基于染色质的筛选以加快选择正确的质粒。我们通过靶向 ADE2 基因测试了 pCEC-red 的基因组编辑效率。我们选择了三个不同的 20 碱基靶标并设计了两种类型的修复片段来测试 pCEC-red 的精确编辑和大型 DNA 区域替换程序。我们获得了两种工程程序的高效率(∼ 90%),表明 pCEC 系统可用于快速、可靠的无标记基因组编辑。

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