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预测药物-靶标相互作用是药物发现的关键。最近基于深度学习的方法表现出色,但仍存在两个挑战:(i)如何明确建模和学习药物与靶标之间的局部相互作用,以便更好地进行预测和解释;(ii)如何将预测性能推广到来自不同分布的新型药物-靶标对。在这项工作中,我们提出了 DrugBAN,这是一个具有域自适应功能的深度双线性注意网络 (BAN) 框架,用于明确学习药物与靶标之间的成对局部相互作用,并适应分布外的数据。DrugBAN 对药物分子图和靶蛋白序列进行预测,使用条件域对抗学习来对齐不同分布中学习到的相互作用表示,以便更好地推广到新型药物-靶标对。在域内和跨域设置下对三个基准数据集进行的实验表明,DrugBAN 在五个最先进的基线上实现了最佳整体性能。此外,可视化学习到的双线性注意图可以从预测结果中获得可解释的见解。

具有领域自适应性的可解释双线性注意网络可改善药物靶标预测

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