香蕉基因组中心提供对香蕉和香蕉近亲的基因组组装、注释和大量相关组学资源的集中访问。实施了一系列工具和独特的界面,以利用香蕉基因组学的潜力,利用比较分析的力量,同时识别数据集之间的差异。除了 BLAST 和 JBrowse 基因组浏览器等有效的基因组工具外,其他界面还支持高级基因搜索和基因家族分析,包括多重比对和系统发育。同源性查看器可以比较染色体级组装之间的基因组结构。还添加了用于差异表达分析、代谢途径和 GO 富集的界面。提供了涵盖香蕉多样性的变体目录,可供探索、过滤和导出到各种软件。此外,我们还实施了新方法,以图形方式探索泛基因组中的基因存在与否以及栽培香蕉的基因组祖先镶嵌。此外,为了指导社区未来的测序工作,我们提供了基因座标签命名法的建议,以及公共基因组资源(组装、重新测序、高密度基因分型)和即将推出的资源(计划中、正在进行中或尚未公开)的精选列表。香蕉基因组中心旨在支持香蕉科学界的基础、转化和应用研究,可在 https://banana-genome-hub.southgreen.fr 上访问。
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