CRISPR/Cas9 编辑的效率和结果取决于切割位点的染色质状态。研究表明,改变染色质状态可以影响效率和修复结果,并且表观遗传药物已被用于改善 Cas9 编辑。然而,由于这些药物的靶蛋白在基因组中分布不均匀,因此这些药物的疗效可能因位点而异。在这里,我们系统地分析了 160 种表观遗传药物的染色质背景依赖性。我们使用具有 19 个稳定整合报告基因的人类细胞系在不同的染色质环境中诱导双链断裂 (DSB)。然后,我们通过对突变特征进行测序来测量 Cas9 编辑效率和修复途径使用情况。我们确定了 67 种药物