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图6：与随机树的真实树与模拟类似物之间的距离之间的关系。对于每个实验（行）和随机方法（列），我们绘制了在随机树（y轴）集合中发现的距离真树的距离与对数类似的距离之间的相关性。为了进行比较，在X轴上绘制了相应的真实系统发育的p值。每个点表示与特定数据集（实验/年组合）相对应的一组随机化。Bootstrap 95％置信区间，颜色表示引导样品的比例，其中对数可能与距离的斜率与距离明显不同。我们发现几乎所有相关性都小于零（固体水平线），并且许多数据集之间的距离和对数似然之间的关系始终存在。对于随机测试p值小于0.05（垂直虚线）的数据集尤其如此。请注意，p值（x轴）显示了方形 - 根 - 以更好的可视化。
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