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会议标题:海报会议#1带茶点会话时间:10月14日,星期一,2:45 pm-5:15 pm海报委员会编号:Epi-mon-101主题类别类别:流行病学提示:临床和公共卫生微生物学中的NGS:基于NGS的医院流行病学的框架的临床和公共卫生微生物学框架:费城,费城,密苏里州,美国;大卫·亨斯塔德(David Hunstad) - 美国密苏里州圣路易斯圣路易斯的华盛顿大学医学院;摘要机构:背景:现代化的NGS医院流行病学实践理想地保护脆弱的患者,同时提高了我们对机会性病原体为何适应医院环境的理解。与导管相关的尿路感染(CAUTIS)是最普遍的医疗保健相关感染之一,而Proteus mirabilis是最常见的CAUTI病原体之一。作为医院范围内的NGS范围内医院流行病学的试验,而圣路易斯华盛顿大学医学院的临床微生物学研究员网上网上介绍了临床上确定的感染中的所有奇异假单胞菌的所有实例,以及临床上的临床或临床上的临床或临床上的象征,以隔离和临床上的隔离序列,以隔离序列分析。常规临床程序如果被认为是适当样本类型的病原体。共生/临床上不明显的分离株最初是通过气味/运动来鉴定的,然后由MALDI-TOF MS确认。使用Illumina技术对总共644个分离株进行了测序。生物纤维形成与亚种指定,一般人口结构,高分辨率SNP关系和泛基因组分析对所有菌株以及公开可用的基因组进行了。代表基因组多样性广度的118个分离株的一个子集具有生物膜形成和运动量化。反应:mirabilis P. mirabilis由三个亚种组成,其中一个亚种在公共数据库中和我们的队列中具有过高的代表性。泛基因组分析确定了由于怀疑外膜定位而导致的许多新型推定的毒力基因。

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