基于杂交链反应机制(HCR)的机制,信号扩增为高度自动荧光样品中RNA和蛋白质靶标的多重,定量,高分辨率成像提供了统一的框架。使用常规的带通成像,由于难以分离具有重叠光谱的荧光团产生的信号,因此多路复用通常限制为四到五个目标。光谱成像提供了更高级别的多重级别的概念承诺,但是在高度自动荧光样品(包括全置脊椎动物胚胎)中实现这种潜力是一项挑战。在这里,我们通过线性隔离来证明强大的HCR光谱成像,从而在整个斑马鱼胚胎和小鼠脑切片中同时进行十个RNA和/或蛋白质靶标的成像。此外,我们证明了十个通道中的每个通道中的每个通道中的放大和未结合信号都是定量的,可以在高度自动含量的样品的解剖学中,可以对具有亚细胞分辨率的RNA和/或蛋白质靶标的准确,精确的相对定量,并具有亚细胞分辨率的RNA绝对定量。