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放大拟合取决于扩增子的序列(Kozarewa等人,2009年),反过来决定通过自我宣布的抑制程度(Acinas等人,2005年)。在实践中,如果一个序列比另一个序列增加20%,则在30轮放大后将是237(1.20 30)倍。按定义,PCR将产生相同的起始材料副本。但是,这些副本并不代表成绩单的原始丰度;我们将它们称为重复。这些不是我们目标的“真实副本”,删除或承认它们符合我们的最大利益。PCR重复可以通过其映射坐标来识别计算。然而,已经表明,重复项的计算去除量低估了转录本的丰度,特别是那些短或高度表达的转录本(Fu Y.等,2018)。一个基因可以被错误地识别为低调的表达,因为我们在试图消除PCR重复的同时部分去除了其真实副本。因此,除去仅依赖其坐标的重复物可能会对下游分析产生负面影响。

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