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可以使用称为Muscle的工具(按日志预期进行多个序列比较)进行比较。灰色区域表明与整体共识匹配,而彩色条/字母显示各个序列不同的地方。可以修剪多个序列比对,然后可以使系统发育树可视化无脊椎动物之间的关系。可用两种类型的系统发育树:邻居加入(NJ)和最大似然(ML)。两者都是外群(即数据集中的无脊椎动物物种与所研究的无脊椎动物物种)被选为确定树的根和分支放置在何处的参考点。
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