噬菌体是感染细菌并使用其宿主机械复制的病毒。它们是生物圈中最普遍,最多样化的生物学实体之一,具有较长的进化史。由于抗菌素耐药性(AMR)水平的增加和新发育的抗生素数量减少,人们对噬菌体治疗剂的兴趣更新。噬菌体在食品安全,水质,生物防治,疫苗和全球营养周期中也有应用。细菌和噬菌体都采用内部和外部自卫策略相互竞争,从而驱动基因组进化。虽然已经对许多噬菌体基因组进行了测序和注释,但噬菌体的蛋白质组学和脂肪组谱却几乎没有被探索,尤其是在感染阶段和溶酶体方面。本评论强调了在添加机器学习等工具的情况下,需要在-omics级别表征噬菌体 - 宿主关系。通过进一步了解噬菌体及其宿主之间的动态相互作用,可以利用合成生物学来设计新的解决方案,以应对我们当前的全球健康,农业和环境挑战。